Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rad23aP54726 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rad23aP54726 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Rad23aP54726 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rad23aP54726 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rad23aP54726 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Rad23aP54726 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rad23aP54726 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Rad23aP54726 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Rad23aP54726 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Rad23aP54726 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rad23aP54726 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rad23aP54726 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rad23aP54726 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rad23aP54726 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rad23aP54726 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rad23aP54726 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Rad23aP54726 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rad23aP54726 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rad23aP54726 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Rad23aP54726 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rad23aP54726 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rad23aP54726 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rad23aP54726 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rad23aP54726 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rad23aP54726 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rad23aP54726 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rad23aP54726 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rad23aP54726 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rad23aP54726 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rad23aP54726 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rad23aP54726 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rad23aP54726 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rad23aP54726 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rad23aP54726 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rad23aP54726 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rad23aP54726 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rad23aP54726 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rad23aP54726 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rad23aP54726 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rad23aP54726 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rad23aP54726 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rad23aP54726 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rad23aP54726 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rad23aP54726 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rad23aP54726 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rad23aP54726 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rad23aP54726 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rad23aP54726 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rad23aP54726 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rad23aP54726 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rad23aP54726 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rad23aP54726 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rad23aP54726 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rad23aP54726 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rad23aP54726 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rad23aP54726 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rad23aP54726 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rad23aP54726 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rad23aP54726 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rad23aP54726 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rad23aP54726 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rad23aP54726 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rad23aP54726 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Rad23aP54726 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rad23aP54726 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rad23aP54726 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Rad23aP54726 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rad23aP54726 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rad23aP54726 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rad23aP54726 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rad23aP54726 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rad23aP54726 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rad23aP54726 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rad23aP54726 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rad23aP54726 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rad23aP54726 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rad23aP54726 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rad23aP54726 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rad23aP54726 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rad23aP54726 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rad23aP54726 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rad23aP54726 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rad23aP54726 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rad23aP54726 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rad23aP54726 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rad23aP54726 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rad23aP54726 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rad23aP54726 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rad23aP54726 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rad23aP54726 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rad23aP54726 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rad23aP54726 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rad23aP54726 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rad23aP54726 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rad23aP54726 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rad23aP54726 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rad23aP54726 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rad23aP54726 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rad23aP54726 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms