Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fdft1P53798 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Fdft1P53798 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fdft1P53798 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fdft1P53798 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fdft1P53798 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fdft1P53798 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fdft1P53798 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fdft1P53798 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fdft1P53798 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fdft1P53798 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fdft1P53798 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fdft1P53798 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fdft1P53798 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fdft1P53798 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fdft1P53798 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fdft1P53798 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fdft1P53798 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fdft1P53798 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fdft1P53798 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fdft1P53798 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fdft1P53798 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Fdft1P53798 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fdft1P53798 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fdft1P53798 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fdft1P53798 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fdft1P53798 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fdft1P53798 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fdft1P53798 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fdft1P53798 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fdft1P53798 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fdft1P53798 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fdft1P53798 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fdft1P53798 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fdft1P53798 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Fdft1P53798 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fdft1P53798 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fdft1P53798 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fdft1P53798 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fdft1P53798 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fdft1P53798 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fdft1P53798 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fdft1P53798 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fdft1P53798 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Fdft1P53798 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fdft1P53798 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fdft1P53798 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fdft1P53798 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fdft1P53798 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fdft1P53798 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fdft1P53798 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Fdft1P53798 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fdft1P53798 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fdft1P53798 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fdft1P53798 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fdft1P53798 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fdft1P53798 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fdft1P53798 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fdft1P53798 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Fdft1P53798 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fdft1P53798 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fdft1P53798 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fdft1P53798 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fdft1P53798 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fdft1P53798 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fdft1P53798 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fdft1P53798 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fdft1P53798 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fdft1P53798 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fdft1P53798 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fdft1P53798 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fdft1P53798 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fdft1P53798 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fdft1P53798 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fdft1P53798 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fdft1P53798 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fdft1P53798 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fdft1P53798 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fdft1P53798 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fdft1P53798 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fdft1P53798 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fdft1P53798 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Fdft1P53798 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fdft1P53798 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fdft1P53798 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fdft1P53798 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fdft1P53798 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fdft1P53798 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fdft1P53798 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fdft1P53798 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fdft1P53798 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fdft1P53798 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Fdft1P53798 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fdft1P53798 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fdft1P53798 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fdft1P53798 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fdft1P53798 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fdft1P53798 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fdft1P53798 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fdft1P53798 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms