Protein–RNA interactions for Protein: P51448

Rora, Nuclear receptor ROR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RoraP51448 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RoraP51448 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
RoraP51448 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
RoraP51448 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RoraP51448 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RoraP51448 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
RoraP51448 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
RoraP51448 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RoraP51448 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RoraP51448 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
RoraP51448 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RoraP51448 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RoraP51448 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RoraP51448 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RoraP51448 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RoraP51448 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
RoraP51448 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
RoraP51448 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RoraP51448 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RoraP51448 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
RoraP51448 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RoraP51448 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
RoraP51448 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RoraP51448 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
RoraP51448 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
RoraP51448 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RoraP51448 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
RoraP51448 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RoraP51448 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
RoraP51448 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
RoraP51448 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RoraP51448 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RoraP51448 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
RoraP51448 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RoraP51448 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RoraP51448 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RoraP51448 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
RoraP51448 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
RoraP51448 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RoraP51448 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RoraP51448 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
RoraP51448 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
RoraP51448 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
RoraP51448 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
RoraP51448 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
RoraP51448 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RoraP51448 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RoraP51448 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
RoraP51448 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
RoraP51448 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
RoraP51448 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RoraP51448 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RoraP51448 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
RoraP51448 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
RoraP51448 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
RoraP51448 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RoraP51448 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RoraP51448 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RoraP51448 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
RoraP51448 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RoraP51448 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
RoraP51448 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RoraP51448 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RoraP51448 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RoraP51448 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RoraP51448 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
RoraP51448 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RoraP51448 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RoraP51448 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
RoraP51448 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
RoraP51448 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
RoraP51448 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
RoraP51448 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
RoraP51448 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RoraP51448 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
RoraP51448 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
RoraP51448 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
RoraP51448 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
RoraP51448 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RoraP51448 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RoraP51448 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RoraP51448 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RoraP51448 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RoraP51448 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
RoraP51448 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
RoraP51448 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
RoraP51448 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC21.29■■□□□ 1
RoraP51448 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RoraP51448 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RoraP51448 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
RoraP51448 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RoraP51448 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RoraP51448 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RoraP51448 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RoraP51448 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
RoraP51448 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
RoraP51448 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RoraP51448 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
RoraP51448 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
RoraP51448 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms