Protein–RNA interactions for Protein: P50706

Defa8, Alpha-defensin 8 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa8P50706 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Defa8P50706 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Defa8P50706 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Defa8P50706 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Defa8P50706 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Defa8P50706 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Defa8P50706 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Defa8P50706 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Defa8P50706 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Defa8P50706 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Defa8P50706 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Defa8P50706 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Defa8P50706 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Defa8P50706 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Defa8P50706 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Defa8P50706 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Defa8P50706 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Defa8P50706 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Defa8P50706 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Defa8P50706 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Defa8P50706 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Defa8P50706 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Defa8P50706 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Defa8P50706 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Defa8P50706 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Defa8P50706 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Defa8P50706 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Defa8P50706 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Defa8P50706 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Defa8P50706 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Defa8P50706 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Defa8P50706 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Defa8P50706 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Defa8P50706 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Defa8P50706 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Defa8P50706 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Defa8P50706 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Defa8P50706 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Defa8P50706 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Defa8P50706 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Defa8P50706 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Defa8P50706 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Defa8P50706 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Defa8P50706 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Defa8P50706 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Defa8P50706 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Defa8P50706 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Defa8P50706 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Defa8P50706 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Defa8P50706 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Defa8P50706 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Defa8P50706 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Defa8P50706 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Defa8P50706 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Defa8P50706 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Defa8P50706 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Defa8P50706 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Defa8P50706 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Defa8P50706 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Defa8P50706 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Defa8P50706 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Defa8P50706 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Defa8P50706 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Defa8P50706 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Defa8P50706 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Defa8P50706 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Defa8P50706 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Defa8P50706 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Defa8P50706 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Defa8P50706 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Defa8P50706 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Defa8P50706 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Defa8P50706 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Defa8P50706 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Defa8P50706 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Defa8P50706 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Defa8P50706 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Defa8P50706 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Defa8P50706 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Defa8P50706 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Defa8P50706 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Defa8P50706 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Defa8P50706 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Defa8P50706 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Defa8P50706 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Defa8P50706 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Defa8P50706 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Defa8P50706 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Defa8P50706 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Defa8P50706 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Defa8P50706 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Defa8P50706 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Defa8P50706 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Defa8P50706 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Defa8P50706 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Defa8P50706 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Defa8P50706 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Defa8P50706 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Defa8P50706 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Defa8P50706 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms