Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FmodP50608 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FmodP50608 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FmodP50608 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FmodP50608 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FmodP50608 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FmodP50608 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
FmodP50608 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
FmodP50608 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FmodP50608 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FmodP50608 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FmodP50608 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FmodP50608 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
FmodP50608 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FmodP50608 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FmodP50608 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
FmodP50608 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FmodP50608 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FmodP50608 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FmodP50608 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FmodP50608 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FmodP50608 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FmodP50608 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
FmodP50608 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FmodP50608 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
FmodP50608 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FmodP50608 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
FmodP50608 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
FmodP50608 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FmodP50608 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FmodP50608 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FmodP50608 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.53
FmodP50608 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
FmodP50608 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FmodP50608 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FmodP50608 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
FmodP50608 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FmodP50608 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
FmodP50608 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FmodP50608 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
FmodP50608 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
FmodP50608 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FmodP50608 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FmodP50608 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FmodP50608 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
FmodP50608 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FmodP50608 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FmodP50608 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FmodP50608 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FmodP50608 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FmodP50608 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FmodP50608 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FmodP50608 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FmodP50608 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FmodP50608 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FmodP50608 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FmodP50608 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FmodP50608 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FmodP50608 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FmodP50608 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FmodP50608 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FmodP50608 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FmodP50608 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FmodP50608 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
FmodP50608 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FmodP50608 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FmodP50608 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FmodP50608 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FmodP50608 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FmodP50608 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FmodP50608 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FmodP50608 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FmodP50608 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FmodP50608 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FmodP50608 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FmodP50608 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FmodP50608 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FmodP50608 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FmodP50608 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FmodP50608 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FmodP50608 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FmodP50608 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FmodP50608 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FmodP50608 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FmodP50608 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FmodP50608 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FmodP50608 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
FmodP50608 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FmodP50608 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FmodP50608 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FmodP50608 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FmodP50608 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FmodP50608 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FmodP50608 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
FmodP50608 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FmodP50608 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FmodP50608 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FmodP50608 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FmodP50608 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FmodP50608 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms