Protein–RNA interactions for Protein: P50481

Lhx3, LIM/homeobox protein Lhx3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx3P50481 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lhx3P50481 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lhx3P50481 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lhx3P50481 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Lhx3P50481 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Lhx3P50481 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lhx3P50481 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lhx3P50481 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Lhx3P50481 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lhx3P50481 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lhx3P50481 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lhx3P50481 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lhx3P50481 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lhx3P50481 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lhx3P50481 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lhx3P50481 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lhx3P50481 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lhx3P50481 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lhx3P50481 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lhx3P50481 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lhx3P50481 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lhx3P50481 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lhx3P50481 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lhx3P50481 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lhx3P50481 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lhx3P50481 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lhx3P50481 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lhx3P50481 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Lhx3P50481 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lhx3P50481 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lhx3P50481 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lhx3P50481 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lhx3P50481 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lhx3P50481 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lhx3P50481 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lhx3P50481 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lhx3P50481 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lhx3P50481 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lhx3P50481 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lhx3P50481 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lhx3P50481 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lhx3P50481 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lhx3P50481 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lhx3P50481 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lhx3P50481 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lhx3P50481 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lhx3P50481 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lhx3P50481 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lhx3P50481 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lhx3P50481 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lhx3P50481 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lhx3P50481 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lhx3P50481 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lhx3P50481 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lhx3P50481 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lhx3P50481 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lhx3P50481 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lhx3P50481 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lhx3P50481 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lhx3P50481 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Lhx3P50481 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lhx3P50481 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lhx3P50481 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lhx3P50481 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lhx3P50481 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lhx3P50481 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lhx3P50481 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lhx3P50481 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lhx3P50481 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lhx3P50481 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Lhx3P50481 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lhx3P50481 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lhx3P50481 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Lhx3P50481 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lhx3P50481 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lhx3P50481 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lhx3P50481 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lhx3P50481 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Lhx3P50481 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lhx3P50481 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lhx3P50481 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Lhx3P50481 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lhx3P50481 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lhx3P50481 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lhx3P50481 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lhx3P50481 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lhx3P50481 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lhx3P50481 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lhx3P50481 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lhx3P50481 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lhx3P50481 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lhx3P50481 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lhx3P50481 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lhx3P50481 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lhx3P50481 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lhx3P50481 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lhx3P50481 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lhx3P50481 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lhx3P50481 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lhx3P50481 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms