Protein–RNA interactions for Protein: P49919

Cdkn1c, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1C, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1cP49919 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdkn1cP49919 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdkn1cP49919 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdkn1cP49919 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdkn1cP49919 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdkn1cP49919 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdkn1cP49919 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdkn1cP49919 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdkn1cP49919 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdkn1cP49919 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdkn1cP49919 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdkn1cP49919 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdkn1cP49919 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdkn1cP49919 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdkn1cP49919 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdkn1cP49919 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdkn1cP49919 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdkn1cP49919 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdkn1cP49919 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdkn1cP49919 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdkn1cP49919 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdkn1cP49919 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdkn1cP49919 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdkn1cP49919 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdkn1cP49919 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdkn1cP49919 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdkn1cP49919 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdkn1cP49919 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdkn1cP49919 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdkn1cP49919 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdkn1cP49919 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdkn1cP49919 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdkn1cP49919 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdkn1cP49919 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdkn1cP49919 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdkn1cP49919 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdkn1cP49919 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdkn1cP49919 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdkn1cP49919 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdkn1cP49919 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdkn1cP49919 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdkn1cP49919 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdkn1cP49919 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cdkn1cP49919 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdkn1cP49919 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdkn1cP49919 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdkn1cP49919 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdkn1cP49919 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdkn1cP49919 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdkn1cP49919 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdkn1cP49919 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdkn1cP49919 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdkn1cP49919 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdkn1cP49919 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdkn1cP49919 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdkn1cP49919 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdkn1cP49919 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdkn1cP49919 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdkn1cP49919 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdkn1cP49919 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdkn1cP49919 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdkn1cP49919 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdkn1cP49919 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdkn1cP49919 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdkn1cP49919 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdkn1cP49919 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdkn1cP49919 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdkn1cP49919 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdkn1cP49919 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdkn1cP49919 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdkn1cP49919 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdkn1cP49919 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdkn1cP49919 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdkn1cP49919 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cdkn1cP49919 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cdkn1cP49919 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cdkn1cP49919 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cdkn1cP49919 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cdkn1cP49919 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cdkn1cP49919 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cdkn1cP49919 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cdkn1cP49919 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdkn1cP49919 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdkn1cP49919 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdkn1cP49919 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdkn1cP49919 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdkn1cP49919 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdkn1cP49919 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdkn1cP49919 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdkn1cP49919 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdkn1cP49919 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdkn1cP49919 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdkn1cP49919 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdkn1cP49919 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdkn1cP49919 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdkn1cP49919 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdkn1cP49919 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdkn1cP49919 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdkn1cP49919 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Cdkn1cP49919 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms