Protein–RNA interactions for Protein: P47962

Rpl5, 60S ribosomal protein L5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl5P47962 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rpl5P47962 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpl5P47962 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpl5P47962 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpl5P47962 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpl5P47962 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpl5P47962 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rpl5P47962 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl5P47962 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl5P47962 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl5P47962 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl5P47962 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl5P47962 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl5P47962 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl5P47962 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl5P47962 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl5P47962 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rpl5P47962 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpl5P47962 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpl5P47962 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpl5P47962 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpl5P47962 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpl5P47962 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rpl5P47962 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpl5P47962 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpl5P47962 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpl5P47962 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpl5P47962 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rpl5P47962 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpl5P47962 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpl5P47962 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpl5P47962 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rpl5P47962 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpl5P47962 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpl5P47962 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpl5P47962 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rpl5P47962 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpl5P47962 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpl5P47962 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpl5P47962 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rpl5P47962 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpl5P47962 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rpl5P47962 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpl5P47962 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rpl5P47962 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpl5P47962 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpl5P47962 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpl5P47962 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rpl5P47962 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpl5P47962 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpl5P47962 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpl5P47962 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpl5P47962 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rpl5P47962 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpl5P47962 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rpl5P47962 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rpl5P47962 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rpl5P47962 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rpl5P47962 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rpl5P47962 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Rpl5P47962 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpl5P47962 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpl5P47962 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpl5P47962 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpl5P47962 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpl5P47962 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Rpl5P47962 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpl5P47962 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpl5P47962 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpl5P47962 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpl5P47962 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpl5P47962 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Rpl5P47962 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpl5P47962 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpl5P47962 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpl5P47962 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rpl5P47962 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpl5P47962 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpl5P47962 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rpl5P47962 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpl5P47962 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpl5P47962 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rpl5P47962 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpl5P47962 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpl5P47962 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpl5P47962 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rpl5P47962 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpl5P47962 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpl5P47962 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpl5P47962 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rpl5P47962 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpl5P47962 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpl5P47962 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rpl5P47962 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Rpl5P47962 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rpl5P47962 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rpl5P47962 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rpl5P47962 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rpl5P47962 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rpl5P47962 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 95.2 ms