Protein–RNA interactions for Protein: P47939

Resp18, Regulated endocrine-specific protein 18, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Resp18P47939 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Resp18P47939 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Resp18P47939 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Resp18P47939 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Resp18P47939 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Resp18P47939 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Resp18P47939 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Resp18P47939 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Resp18P47939 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Resp18P47939 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Resp18P47939 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Resp18P47939 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Resp18P47939 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Resp18P47939 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Resp18P47939 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Resp18P47939 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Resp18P47939 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Resp18P47939 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Resp18P47939 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Resp18P47939 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Resp18P47939 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Resp18P47939 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Resp18P47939 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Resp18P47939 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Resp18P47939 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Resp18P47939 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Resp18P47939 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Resp18P47939 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Resp18P47939 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Resp18P47939 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Resp18P47939 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Resp18P47939 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Resp18P47939 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Resp18P47939 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Resp18P47939 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Resp18P47939 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Resp18P47939 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Resp18P47939 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Resp18P47939 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Resp18P47939 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Resp18P47939 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Resp18P47939 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Resp18P47939 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Resp18P47939 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Resp18P47939 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Resp18P47939 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Resp18P47939 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Resp18P47939 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Resp18P47939 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Resp18P47939 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Resp18P47939 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Resp18P47939 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Resp18P47939 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Resp18P47939 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Resp18P47939 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Resp18P47939 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Resp18P47939 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Resp18P47939 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Resp18P47939 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Resp18P47939 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Resp18P47939 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Resp18P47939 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Resp18P47939 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Resp18P47939 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Resp18P47939 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Resp18P47939 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Resp18P47939 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Resp18P47939 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Resp18P47939 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Resp18P47939 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Resp18P47939 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Resp18P47939 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Resp18P47939 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Resp18P47939 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Resp18P47939 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Resp18P47939 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Resp18P47939 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Resp18P47939 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Resp18P47939 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Resp18P47939 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Resp18P47939 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Resp18P47939 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Resp18P47939 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Resp18P47939 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Resp18P47939 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Resp18P47939 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Resp18P47939 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Resp18P47939 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Resp18P47939 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Resp18P47939 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Resp18P47939 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Resp18P47939 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Resp18P47939 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Resp18P47939 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Resp18P47939 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Resp18P47939 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Resp18P47939 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Resp18P47939 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Resp18P47939 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Resp18P47939 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms