Protein–RNA interactions for Protein: P46684

Zic1, Zinc finger protein ZIC 1, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zic1P46684 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zic1P46684 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Zic1P46684 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zic1P46684 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zic1P46684 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zic1P46684 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zic1P46684 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Zic1P46684 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zic1P46684 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zic1P46684 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zic1P46684 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Zic1P46684 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zic1P46684 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zic1P46684 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Zic1P46684 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zic1P46684 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zic1P46684 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zic1P46684 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Zic1P46684 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zic1P46684 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zic1P46684 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Zic1P46684 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zic1P46684 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Zic1P46684 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zic1P46684 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zic1P46684 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zic1P46684 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zic1P46684 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zic1P46684 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Zic1P46684 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zic1P46684 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Zic1P46684 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zic1P46684 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zic1P46684 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Zic1P46684 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zic1P46684 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zic1P46684 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Zic1P46684 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Zic1P46684 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Zic1P46684 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zic1P46684 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zic1P46684 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zic1P46684 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zic1P46684 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zic1P46684 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Zic1P46684 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zic1P46684 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zic1P46684 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zic1P46684 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zic1P46684 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zic1P46684 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zic1P46684 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Zic1P46684 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Zic1P46684 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Zic1P46684 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zic1P46684 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Zic1P46684 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zic1P46684 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zic1P46684 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zic1P46684 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zic1P46684 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zic1P46684 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Zic1P46684 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zic1P46684 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zic1P46684 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zic1P46684 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zic1P46684 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zic1P46684 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zic1P46684 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Zic1P46684 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zic1P46684 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Zic1P46684 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zic1P46684 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zic1P46684 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zic1P46684 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zic1P46684 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Zic1P46684 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zic1P46684 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zic1P46684 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zic1P46684 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zic1P46684 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Zic1P46684 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Zic1P46684 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zic1P46684 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Zic1P46684 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zic1P46684 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zic1P46684 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zic1P46684 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Zic1P46684 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zic1P46684 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Zic1P46684 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zic1P46684 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zic1P46684 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zic1P46684 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Zic1P46684 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zic1P46684 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Zic1P46684 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zic1P46684 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zic1P46684 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Zic1P46684 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms