Protein–RNA interactions for Protein: P46471

Psmc2, 26S proteasome regulatory subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc2P46471 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Psmc2P46471 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Psmc2P46471 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Psmc2P46471 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Psmc2P46471 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Psmc2P46471 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Psmc2P46471 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Psmc2P46471 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Psmc2P46471 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Psmc2P46471 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Psmc2P46471 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Psmc2P46471 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Psmc2P46471 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Psmc2P46471 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Psmc2P46471 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Psmc2P46471 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Psmc2P46471 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Psmc2P46471 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Psmc2P46471 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Psmc2P46471 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Psmc2P46471 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Psmc2P46471 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Psmc2P46471 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Psmc2P46471 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Psmc2P46471 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Psmc2P46471 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Psmc2P46471 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Psmc2P46471 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Psmc2P46471 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Psmc2P46471 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Psmc2P46471 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Psmc2P46471 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Psmc2P46471 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Psmc2P46471 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Psmc2P46471 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Psmc2P46471 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Psmc2P46471 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Psmc2P46471 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Psmc2P46471 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Psmc2P46471 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Psmc2P46471 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Psmc2P46471 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Psmc2P46471 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Psmc2P46471 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Psmc2P46471 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Psmc2P46471 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Psmc2P46471 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Psmc2P46471 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Psmc2P46471 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Psmc2P46471 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Psmc2P46471 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Psmc2P46471 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Psmc2P46471 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Psmc2P46471 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Psmc2P46471 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Psmc2P46471 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Psmc2P46471 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Psmc2P46471 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Psmc2P46471 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Psmc2P46471 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Psmc2P46471 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Psmc2P46471 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Psmc2P46471 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Psmc2P46471 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Psmc2P46471 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Psmc2P46471 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Psmc2P46471 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Psmc2P46471 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Psmc2P46471 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Psmc2P46471 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Psmc2P46471 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Psmc2P46471 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Psmc2P46471 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Psmc2P46471 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Psmc2P46471 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Psmc2P46471 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Psmc2P46471 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Psmc2P46471 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Psmc2P46471 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Psmc2P46471 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Psmc2P46471 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Psmc2P46471 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Psmc2P46471 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Psmc2P46471 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Psmc2P46471 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Psmc2P46471 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Psmc2P46471 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Psmc2P46471 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Psmc2P46471 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Psmc2P46471 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Psmc2P46471 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Psmc2P46471 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Psmc2P46471 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Psmc2P46471 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Psmc2P46471 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Psmc2P46471 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Psmc2P46471 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Psmc2P46471 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Psmc2P46471 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Psmc2P46471 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms