Protein–RNA interactions for Protein: P43406

Itgav, Integrin alpha-V, mousemouse

Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgavP43406 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ItgavP43406 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ItgavP43406 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ItgavP43406 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ItgavP43406 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ItgavP43406 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ItgavP43406 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ItgavP43406 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ItgavP43406 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ItgavP43406 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ItgavP43406 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ItgavP43406 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ItgavP43406 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ItgavP43406 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ItgavP43406 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ItgavP43406 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ItgavP43406 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ItgavP43406 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ItgavP43406 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ItgavP43406 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ItgavP43406 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ItgavP43406 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ItgavP43406 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ItgavP43406 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ItgavP43406 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ItgavP43406 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ItgavP43406 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ItgavP43406 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ItgavP43406 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ItgavP43406 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ItgavP43406 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ItgavP43406 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ItgavP43406 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ItgavP43406 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
ItgavP43406 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ItgavP43406 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ItgavP43406 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ItgavP43406 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ItgavP43406 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ItgavP43406 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ItgavP43406 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ItgavP43406 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ItgavP43406 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ItgavP43406 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ItgavP43406 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ItgavP43406 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ItgavP43406 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ItgavP43406 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ItgavP43406 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ItgavP43406 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ItgavP43406 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ItgavP43406 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ItgavP43406 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ItgavP43406 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
ItgavP43406 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ItgavP43406 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ItgavP43406 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ItgavP43406 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ItgavP43406 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ItgavP43406 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
ItgavP43406 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ItgavP43406 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ItgavP43406 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ItgavP43406 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ItgavP43406 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ItgavP43406 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ItgavP43406 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ItgavP43406 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ItgavP43406 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ItgavP43406 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ItgavP43406 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ItgavP43406 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ItgavP43406 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ItgavP43406 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ItgavP43406 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ItgavP43406 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ItgavP43406 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ItgavP43406 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ItgavP43406 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ItgavP43406 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ItgavP43406 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ItgavP43406 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ItgavP43406 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ItgavP43406 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ItgavP43406 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
ItgavP43406 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ItgavP43406 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ItgavP43406 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ItgavP43406 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ItgavP43406 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ItgavP43406 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
ItgavP43406 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
ItgavP43406 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
ItgavP43406 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
ItgavP43406 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
ItgavP43406 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
ItgavP43406 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
ItgavP43406 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ItgavP43406 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
ItgavP43406 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 183.4 ms