Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nkx1-2P42580 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nkx1-2P42580 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nkx1-2P42580 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nkx1-2P42580 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nkx1-2P42580 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nkx1-2P42580 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nkx1-2P42580 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nkx1-2P42580 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Nkx1-2P42580 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nkx1-2P42580 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nkx1-2P42580 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nkx1-2P42580 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nkx1-2P42580 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nkx1-2P42580 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nkx1-2P42580 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nkx1-2P42580 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nkx1-2P42580 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nkx1-2P42580 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nkx1-2P42580 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nkx1-2P42580 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nkx1-2P42580 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nkx1-2P42580 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nkx1-2P42580 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nkx1-2P42580 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nkx1-2P42580 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nkx1-2P42580 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nkx1-2P42580 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nkx1-2P42580 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nkx1-2P42580 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nkx1-2P42580 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
Nkx1-2P42580 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nkx1-2P42580 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nkx1-2P42580 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nkx1-2P42580 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nkx1-2P42580 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nkx1-2P42580 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nkx1-2P42580 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Nkx1-2P42580 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Nkx1-2P42580 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Nkx1-2P42580 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nkx1-2P42580 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nkx1-2P42580 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nkx1-2P42580 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nkx1-2P42580 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nkx1-2P42580 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nkx1-2P42580 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nkx1-2P42580 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nkx1-2P42580 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nkx1-2P42580 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nkx1-2P42580 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nkx1-2P42580 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nkx1-2P42580 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nkx1-2P42580 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nkx1-2P42580 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nkx1-2P42580 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nkx1-2P42580 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nkx1-2P42580 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Nkx1-2P42580 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nkx1-2P42580 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nkx1-2P42580 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nkx1-2P42580 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nkx1-2P42580 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Nkx1-2P42580 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nkx1-2P42580 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nkx1-2P42580 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nkx1-2P42580 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nkx1-2P42580 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nkx1-2P42580 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Nkx1-2P42580 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nkx1-2P42580 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nkx1-2P42580 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nkx1-2P42580 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nkx1-2P42580 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nkx1-2P42580 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nkx1-2P42580 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nkx1-2P42580 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nkx1-2P42580 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nkx1-2P42580 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nkx1-2P42580 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Nkx1-2P42580 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Nkx1-2P42580 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Nkx1-2P42580 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nkx1-2P42580 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Nkx1-2P42580 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nkx1-2P42580 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Nkx1-2P42580 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
Nkx1-2P42580 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nkx1-2P42580 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Nkx1-2P42580 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nkx1-2P42580 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nkx1-2P42580 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nkx1-2P42580 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nkx1-2P42580 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nkx1-2P42580 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nkx1-2P42580 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Nkx1-2P42580 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
Nkx1-2P42580 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nkx1-2P42580 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Nkx1-2P42580 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms