Protein–RNA interactions for Protein: P41539

Tac1, Protachykinin-1, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tac1P41539 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tac1P41539 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Tac1P41539 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tac1P41539 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tac1P41539 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tac1P41539 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tac1P41539 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tac1P41539 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tac1P41539 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tac1P41539 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tac1P41539 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tac1P41539 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tac1P41539 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Tac1P41539 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tac1P41539 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tac1P41539 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tac1P41539 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Tac1P41539 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tac1P41539 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tac1P41539 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tac1P41539 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tac1P41539 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tac1P41539 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tac1P41539 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Tac1P41539 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tac1P41539 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tac1P41539 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tac1P41539 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tac1P41539 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tac1P41539 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tac1P41539 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tac1P41539 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Tac1P41539 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tac1P41539 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tac1P41539 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tac1P41539 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tac1P41539 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tac1P41539 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tac1P41539 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tac1P41539 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tac1P41539 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tac1P41539 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tac1P41539 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tac1P41539 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tac1P41539 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tac1P41539 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Tac1P41539 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Tac1P41539 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tac1P41539 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tac1P41539 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tac1P41539 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tac1P41539 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tac1P41539 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tac1P41539 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tac1P41539 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tac1P41539 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tac1P41539 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tac1P41539 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tac1P41539 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tac1P41539 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Tac1P41539 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tac1P41539 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tac1P41539 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tac1P41539 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Tac1P41539 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tac1P41539 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tac1P41539 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tac1P41539 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tac1P41539 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tac1P41539 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tac1P41539 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Tac1P41539 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tac1P41539 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tac1P41539 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tac1P41539 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tac1P41539 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tac1P41539 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tac1P41539 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tac1P41539 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tac1P41539 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tac1P41539 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tac1P41539 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tac1P41539 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tac1P41539 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tac1P41539 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tac1P41539 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tac1P41539 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tac1P41539 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tac1P41539 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tac1P41539 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tac1P41539 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tac1P41539 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tac1P41539 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tac1P41539 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tac1P41539 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Tac1P41539 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tac1P41539 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tac1P41539 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tac1P41539 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tac1P41539 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.5 ms