Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Traf2P39429 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Traf2P39429 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Traf2P39429 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Traf2P39429 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Traf2P39429 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Traf2P39429 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Traf2P39429 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Traf2P39429 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Traf2P39429 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Traf2P39429 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Traf2P39429 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Traf2P39429 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Traf2P39429 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Traf2P39429 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Traf2P39429 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Traf2P39429 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Traf2P39429 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Traf2P39429 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Traf2P39429 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Traf2P39429 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Traf2P39429 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Traf2P39429 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Traf2P39429 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Traf2P39429 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Traf2P39429 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Traf2P39429 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Traf2P39429 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Traf2P39429 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Traf2P39429 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Traf2P39429 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Traf2P39429 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Traf2P39429 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Traf2P39429 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Traf2P39429 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Traf2P39429 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Traf2P39429 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Traf2P39429 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Traf2P39429 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Traf2P39429 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Traf2P39429 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Traf2P39429 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Traf2P39429 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Traf2P39429 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Traf2P39429 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Traf2P39429 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Traf2P39429 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Traf2P39429 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Traf2P39429 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Traf2P39429 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Traf2P39429 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Traf2P39429 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Traf2P39429 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Traf2P39429 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Traf2P39429 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Traf2P39429 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Traf2P39429 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Traf2P39429 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Traf2P39429 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Traf2P39429 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Traf2P39429 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Traf2P39429 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Traf2P39429 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Traf2P39429 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Traf2P39429 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Traf2P39429 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Traf2P39429 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Traf2P39429 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Traf2P39429 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Traf2P39429 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Traf2P39429 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Traf2P39429 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Traf2P39429 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Traf2P39429 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Traf2P39429 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Traf2P39429 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Traf2P39429 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Traf2P39429 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Traf2P39429 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Traf2P39429 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Traf2P39429 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Traf2P39429 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Traf2P39429 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Traf2P39429 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Traf2P39429 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Traf2P39429 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Traf2P39429 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Traf2P39429 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Traf2P39429 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Traf2P39429 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Traf2P39429 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Traf2P39429 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Traf2P39429 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Traf2P39429 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Traf2P39429 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Traf2P39429 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Traf2P39429 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Traf2P39429 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Traf2P39429 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Traf2P39429 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms