Protein–RNA interactions for Protein: P33896

Ifnar1, Interferon alpha/beta receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnar1P33896 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ifnar1P33896 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ifnar1P33896 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ifnar1P33896 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ifnar1P33896 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ifnar1P33896 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ifnar1P33896 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ifnar1P33896 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Ifnar1P33896 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ifnar1P33896 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Ifnar1P33896 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Ifnar1P33896 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ifnar1P33896 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Ifnar1P33896 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ifnar1P33896 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ifnar1P33896 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ifnar1P33896 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Ifnar1P33896 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ifnar1P33896 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ifnar1P33896 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ifnar1P33896 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ifnar1P33896 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ifnar1P33896 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Ifnar1P33896 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ifnar1P33896 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ifnar1P33896 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ifnar1P33896 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ifnar1P33896 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ifnar1P33896 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Ifnar1P33896 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ifnar1P33896 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Ifnar1P33896 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ifnar1P33896 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ifnar1P33896 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ifnar1P33896 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ifnar1P33896 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ifnar1P33896 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ifnar1P33896 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ifnar1P33896 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Ifnar1P33896 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Ifnar1P33896 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Ifnar1P33896 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ifnar1P33896 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Ifnar1P33896 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ifnar1P33896 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Ifnar1P33896 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ifnar1P33896 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ifnar1P33896 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ifnar1P33896 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ifnar1P33896 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ifnar1P33896 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Ifnar1P33896 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ifnar1P33896 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ifnar1P33896 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Ifnar1P33896 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Ifnar1P33896 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ifnar1P33896 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Ifnar1P33896 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ifnar1P33896 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ifnar1P33896 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Ifnar1P33896 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ifnar1P33896 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Ifnar1P33896 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ifnar1P33896 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ifnar1P33896 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Ifnar1P33896 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Ifnar1P33896 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Ifnar1P33896 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Ifnar1P33896 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ifnar1P33896 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Ifnar1P33896 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ifnar1P33896 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ifnar1P33896 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Ifnar1P33896 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Ifnar1P33896 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Ifnar1P33896 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ifnar1P33896 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ifnar1P33896 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Ifnar1P33896 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ifnar1P33896 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ifnar1P33896 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Ifnar1P33896 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ifnar1P33896 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Ifnar1P33896 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ifnar1P33896 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Ifnar1P33896 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ifnar1P33896 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ifnar1P33896 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Ifnar1P33896 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ifnar1P33896 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ifnar1P33896 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ifnar1P33896 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ifnar1P33896 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Ifnar1P33896 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ifnar1P33896 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ifnar1P33896 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ifnar1P33896 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ifnar1P33896 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ifnar1P33896 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ifnar1P33896 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms