Protein–RNA interactions for Protein: P33611

Pola2, DNA polymerase alpha subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola2P33611 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Pola2P33611 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pola2P33611 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pola2P33611 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pola2P33611 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Pola2P33611 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pola2P33611 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pola2P33611 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pola2P33611 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pola2P33611 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pola2P33611 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pola2P33611 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pola2P33611 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pola2P33611 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pola2P33611 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pola2P33611 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pola2P33611 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pola2P33611 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pola2P33611 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pola2P33611 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pola2P33611 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Pola2P33611 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pola2P33611 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pola2P33611 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pola2P33611 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pola2P33611 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pola2P33611 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pola2P33611 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pola2P33611 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pola2P33611 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pola2P33611 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pola2P33611 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pola2P33611 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pola2P33611 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pola2P33611 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pola2P33611 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pola2P33611 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pola2P33611 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pola2P33611 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pola2P33611 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pola2P33611 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pola2P33611 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pola2P33611 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pola2P33611 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pola2P33611 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pola2P33611 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pola2P33611 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Pola2P33611 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pola2P33611 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pola2P33611 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pola2P33611 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pola2P33611 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pola2P33611 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Pola2P33611 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pola2P33611 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pola2P33611 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pola2P33611 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pola2P33611 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pola2P33611 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pola2P33611 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pola2P33611 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pola2P33611 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pola2P33611 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pola2P33611 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pola2P33611 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pola2P33611 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pola2P33611 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pola2P33611 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pola2P33611 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pola2P33611 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pola2P33611 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pola2P33611 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pola2P33611 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pola2P33611 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pola2P33611 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pola2P33611 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pola2P33611 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pola2P33611 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pola2P33611 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pola2P33611 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pola2P33611 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pola2P33611 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pola2P33611 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pola2P33611 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pola2P33611 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pola2P33611 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pola2P33611 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pola2P33611 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pola2P33611 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pola2P33611 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pola2P33611 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pola2P33611 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pola2P33611 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pola2P33611 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pola2P33611 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pola2P33611 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pola2P33611 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Pola2P33611 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pola2P33611 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pola2P33611 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms