Protein–RNA interactions for Protein: P33610

Prim2, DNA primase large subunit, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prim2P33610 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Prim2P33610 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prim2P33610 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prim2P33610 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prim2P33610 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prim2P33610 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prim2P33610 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Prim2P33610 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prim2P33610 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Prim2P33610 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Prim2P33610 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prim2P33610 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prim2P33610 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prim2P33610 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prim2P33610 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prim2P33610 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prim2P33610 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Prim2P33610 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prim2P33610 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prim2P33610 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prim2P33610 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Prim2P33610 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prim2P33610 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prim2P33610 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Prim2P33610 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Prim2P33610 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prim2P33610 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prim2P33610 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prim2P33610 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prim2P33610 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prim2P33610 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Prim2P33610 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prim2P33610 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prim2P33610 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prim2P33610 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Prim2P33610 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prim2P33610 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Prim2P33610 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prim2P33610 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Prim2P33610 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prim2P33610 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prim2P33610 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prim2P33610 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prim2P33610 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Prim2P33610 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Prim2P33610 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prim2P33610 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Prim2P33610 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prim2P33610 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Prim2P33610 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Prim2P33610 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prim2P33610 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prim2P33610 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prim2P33610 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Prim2P33610 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prim2P33610 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prim2P33610 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prim2P33610 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Prim2P33610 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prim2P33610 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prim2P33610 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Prim2P33610 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
Prim2P33610 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prim2P33610 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prim2P33610 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prim2P33610 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prim2P33610 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Prim2P33610 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prim2P33610 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prim2P33610 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Prim2P33610 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prim2P33610 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prim2P33610 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prim2P33610 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prim2P33610 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prim2P33610 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prim2P33610 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prim2P33610 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prim2P33610 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prim2P33610 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prim2P33610 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prim2P33610 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prim2P33610 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prim2P33610 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prim2P33610 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prim2P33610 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prim2P33610 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prim2P33610 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prim2P33610 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prim2P33610 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prim2P33610 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prim2P33610 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prim2P33610 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prim2P33610 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prim2P33610 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prim2P33610 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prim2P33610 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prim2P33610 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prim2P33610 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prim2P33610 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms