Protein–RNA interactions for Protein: P31041

Cd28, T-cell-specific surface glycoprotein CD28, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd28P31041 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cd28P31041 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cd28P31041 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cd28P31041 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd28P31041 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd28P31041 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd28P31041 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd28P31041 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd28P31041 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd28P31041 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd28P31041 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd28P31041 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cd28P31041 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd28P31041 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd28P31041 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd28P31041 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cd28P31041 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cd28P31041 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cd28P31041 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cd28P31041 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Cd28P31041 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.79
Cd28P31041 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd28P31041 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd28P31041 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd28P31041 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd28P31041 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Cd28P31041 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd28P31041 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd28P31041 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd28P31041 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd28P31041 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd28P31041 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd28P31041 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd28P31041 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd28P31041 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cd28P31041 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd28P31041 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd28P31041 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd28P31041 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd28P31041 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd28P31041 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd28P31041 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd28P31041 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd28P31041 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd28P31041 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cd28P31041 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cd28P31041 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cd28P31041 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cd28P31041 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cd28P31041 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cd28P31041 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Cd28P31041 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cd28P31041 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cd28P31041 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cd28P31041 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cd28P31041 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Cd28P31041 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Cd28P31041 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cd28P31041 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cd28P31041 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cd28P31041 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cd28P31041 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cd28P31041 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cd28P31041 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cd28P31041 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cd28P31041 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cd28P31041 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cd28P31041 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cd28P31041 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cd28P31041 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cd28P31041 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cd28P31041 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cd28P31041 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cd28P31041 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cd28P31041 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cd28P31041 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cd28P31041 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cd28P31041 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cd28P31041 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cd28P31041 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Cd28P31041 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cd28P31041 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cd28P31041 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cd28P31041 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cd28P31041 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cd28P31041 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cd28P31041 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cd28P31041 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cd28P31041 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cd28P31041 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cd28P31041 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cd28P31041 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cd28P31041 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cd28P31041 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cd28P31041 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Cd28P31041 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cd28P31041 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cd28P31041 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Cd28P31041 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cd28P31041 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms