Protein–RNA interactions for Protein: P30285

Cdk4, Cyclin-dependent kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk4P30285 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdk4P30285 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdk4P30285 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdk4P30285 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdk4P30285 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdk4P30285 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdk4P30285 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdk4P30285 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdk4P30285 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdk4P30285 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdk4P30285 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdk4P30285 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdk4P30285 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdk4P30285 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdk4P30285 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdk4P30285 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdk4P30285 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdk4P30285 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdk4P30285 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdk4P30285 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdk4P30285 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cdk4P30285 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdk4P30285 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdk4P30285 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdk4P30285 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdk4P30285 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdk4P30285 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdk4P30285 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdk4P30285 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdk4P30285 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdk4P30285 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdk4P30285 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdk4P30285 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdk4P30285 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdk4P30285 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdk4P30285 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdk4P30285 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cdk4P30285 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdk4P30285 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdk4P30285 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdk4P30285 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdk4P30285 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdk4P30285 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdk4P30285 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cdk4P30285 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cdk4P30285 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cdk4P30285 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdk4P30285 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdk4P30285 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdk4P30285 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdk4P30285 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdk4P30285 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdk4P30285 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdk4P30285 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdk4P30285 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdk4P30285 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdk4P30285 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdk4P30285 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cdk4P30285 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdk4P30285 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdk4P30285 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdk4P30285 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdk4P30285 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdk4P30285 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdk4P30285 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdk4P30285 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdk4P30285 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdk4P30285 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdk4P30285 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdk4P30285 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cdk4P30285 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cdk4P30285 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cdk4P30285 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cdk4P30285 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cdk4P30285 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdk4P30285 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cdk4P30285 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdk4P30285 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdk4P30285 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdk4P30285 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdk4P30285 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdk4P30285 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdk4P30285 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdk4P30285 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdk4P30285 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdk4P30285 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Cdk4P30285 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdk4P30285 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdk4P30285 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdk4P30285 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdk4P30285 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdk4P30285 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdk4P30285 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdk4P30285 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdk4P30285 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdk4P30285 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdk4P30285 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdk4P30285 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdk4P30285 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdk4P30285 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms