Protein–RNA interactions for Protein: P28334

Htr1b, 5-hydroxytryptamine receptor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1bP28334 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Htr1bP28334 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Htr1bP28334 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Htr1bP28334 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Htr1bP28334 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Htr1bP28334 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Htr1bP28334 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Htr1bP28334 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Htr1bP28334 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Htr1bP28334 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Htr1bP28334 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Htr1bP28334 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Htr1bP28334 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Htr1bP28334 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Htr1bP28334 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Htr1bP28334 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Htr1bP28334 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Htr1bP28334 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Htr1bP28334 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Htr1bP28334 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Htr1bP28334 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Htr1bP28334 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Htr1bP28334 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Htr1bP28334 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Htr1bP28334 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Htr1bP28334 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Htr1bP28334 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Htr1bP28334 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Htr1bP28334 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Htr1bP28334 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Htr1bP28334 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Htr1bP28334 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Htr1bP28334 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Htr1bP28334 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Htr1bP28334 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Htr1bP28334 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Htr1bP28334 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Htr1bP28334 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Htr1bP28334 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Htr1bP28334 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Htr1bP28334 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Htr1bP28334 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Htr1bP28334 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Htr1bP28334 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Htr1bP28334 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Htr1bP28334 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Htr1bP28334 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Htr1bP28334 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Htr1bP28334 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Htr1bP28334 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Htr1bP28334 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Htr1bP28334 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Htr1bP28334 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Htr1bP28334 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Htr1bP28334 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Htr1bP28334 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Htr1bP28334 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Htr1bP28334 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Htr1bP28334 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Htr1bP28334 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Htr1bP28334 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Htr1bP28334 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Htr1bP28334 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Htr1bP28334 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Htr1bP28334 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Htr1bP28334 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
Htr1bP28334 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Htr1bP28334 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Htr1bP28334 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Htr1bP28334 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Htr1bP28334 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Htr1bP28334 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Htr1bP28334 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Htr1bP28334 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Htr1bP28334 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Htr1bP28334 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Htr1bP28334 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Htr1bP28334 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Htr1bP28334 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Htr1bP28334 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Htr1bP28334 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Htr1bP28334 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Htr1bP28334 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Htr1bP28334 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Htr1bP28334 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Htr1bP28334 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Htr1bP28334 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Htr1bP28334 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Htr1bP28334 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Htr1bP28334 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Htr1bP28334 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Htr1bP28334 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Htr1bP28334 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Htr1bP28334 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Htr1bP28334 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Htr1bP28334 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Htr1bP28334 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Htr1bP28334 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Htr1bP28334 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Htr1bP28334 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms