Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pde6aP27664 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pde6aP27664 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pde6aP27664 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Pde6aP27664 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pde6aP27664 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pde6aP27664 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pde6aP27664 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pde6aP27664 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pde6aP27664 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pde6aP27664 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pde6aP27664 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pde6aP27664 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pde6aP27664 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pde6aP27664 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Pde6aP27664 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pde6aP27664 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pde6aP27664 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pde6aP27664 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pde6aP27664 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pde6aP27664 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pde6aP27664 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pde6aP27664 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pde6aP27664 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pde6aP27664 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pde6aP27664 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Pde6aP27664 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pde6aP27664 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pde6aP27664 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pde6aP27664 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Pde6aP27664 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pde6aP27664 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Pde6aP27664 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Pde6aP27664 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Pde6aP27664 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Pde6aP27664 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pde6aP27664 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pde6aP27664 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pde6aP27664 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pde6aP27664 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pde6aP27664 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pde6aP27664 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pde6aP27664 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pde6aP27664 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pde6aP27664 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Pde6aP27664 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pde6aP27664 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pde6aP27664 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pde6aP27664 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pde6aP27664 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pde6aP27664 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pde6aP27664 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
Pde6aP27664 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pde6aP27664 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pde6aP27664 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Pde6aP27664 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pde6aP27664 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
Pde6aP27664 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pde6aP27664 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pde6aP27664 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pde6aP27664 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Pde6aP27664 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pde6aP27664 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pde6aP27664 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pde6aP27664 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Pde6aP27664 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pde6aP27664 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pde6aP27664 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pde6aP27664 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pde6aP27664 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pde6aP27664 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pde6aP27664 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pde6aP27664 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pde6aP27664 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pde6aP27664 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Pde6aP27664 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pde6aP27664 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pde6aP27664 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pde6aP27664 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pde6aP27664 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pde6aP27664 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pde6aP27664 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
Pde6aP27664 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pde6aP27664 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pde6aP27664 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pde6aP27664 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pde6aP27664 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pde6aP27664 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Pde6aP27664 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pde6aP27664 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pde6aP27664 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pde6aP27664 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pde6aP27664 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pde6aP27664 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pde6aP27664 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pde6aP27664 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pde6aP27664 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pde6aP27664 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pde6aP27664 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pde6aP27664 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms