Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H2afxP27661 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
H2afxP27661 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
H2afxP27661 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
H2afxP27661 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
H2afxP27661 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
H2afxP27661 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H2afxP27661 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H2afxP27661 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H2afxP27661 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H2afxP27661 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
H2afxP27661 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
H2afxP27661 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
H2afxP27661 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
H2afxP27661 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
H2afxP27661 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
H2afxP27661 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
H2afxP27661 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
H2afxP27661 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
H2afxP27661 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
H2afxP27661 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H2afxP27661 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H2afxP27661 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
H2afxP27661 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
H2afxP27661 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
H2afxP27661 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
H2afxP27661 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
H2afxP27661 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H2afxP27661 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
H2afxP27661 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H2afxP27661 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
H2afxP27661 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H2afxP27661 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC24■■□□□ 1.43
H2afxP27661 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
H2afxP27661 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H2afxP27661 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
H2afxP27661 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
H2afxP27661 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
H2afxP27661 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H2afxP27661 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
H2afxP27661 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
H2afxP27661 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
H2afxP27661 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
H2afxP27661 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
H2afxP27661 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
H2afxP27661 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
H2afxP27661 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H2afxP27661 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
H2afxP27661 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
H2afxP27661 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
H2afxP27661 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
H2afxP27661 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
H2afxP27661 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
H2afxP27661 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
H2afxP27661 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
H2afxP27661 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
H2afxP27661 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
H2afxP27661 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
H2afxP27661 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
H2afxP27661 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
H2afxP27661 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
H2afxP27661 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
H2afxP27661 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
H2afxP27661 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
H2afxP27661 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
H2afxP27661 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
H2afxP27661 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
H2afxP27661 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
H2afxP27661 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
H2afxP27661 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
H2afxP27661 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
H2afxP27661 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
H2afxP27661 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
H2afxP27661 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
H2afxP27661 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
H2afxP27661 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
H2afxP27661 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
H2afxP27661 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
H2afxP27661 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
H2afxP27661 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
H2afxP27661 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
H2afxP27661 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
H2afxP27661 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
H2afxP27661 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
H2afxP27661 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
H2afxP27661 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
H2afxP27661 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
H2afxP27661 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
H2afxP27661 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
H2afxP27661 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
H2afxP27661 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
H2afxP27661 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
H2afxP27661 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
H2afxP27661 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
H2afxP27661 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
H2afxP27661 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
H2afxP27661 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
H2afxP27661 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
H2afxP27661 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
H2afxP27661 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms