Protein–RNA interactions for Protein: P26687

Twist1, Twist-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Twist1P26687 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC17,57■□□□□ 0,4
Twist1P26687 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,57■□□□□ 0,4
Twist1P26687 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17,57■□□□□ 0,4
Twist1P26687 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17,57■□□□□ 0,4
Twist1P26687 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,57■□□□□ 0,4
Twist1P26687 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,57■□□□□ 0,4
Twist1P26687 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,57■□□□□ 0,4
Twist1P26687 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,56■□□□□ 0,4
Twist1P26687 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC17,56■□□□□ 0,4
Twist1P26687 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,55■□□□□ 0,4
Twist1P26687 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,55■□□□□ 0,4
Twist1P26687 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,55■□□□□ 0,4
Twist1P26687 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,54■□□□□ 0,4
Twist1P26687 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC17,54■□□□□ 0,4
Twist1P26687 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,54■□□□□ 0,4
Twist1P26687 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17,54■□□□□ 0,4
Twist1P26687 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,54■□□□□ 0,4
Twist1P26687 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17,53■□□□□ 0,4
Twist1P26687 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,53■□□□□ 0,4
Twist1P26687 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17,53■□□□□ 0,4
Twist1P26687 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,53■□□□□ 0,4
Twist1P26687 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC17,53■□□□□ 0,4
Twist1P26687 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17,53■□□□□ 0,4
Twist1P26687 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,53■□□□□ 0,4
Twist1P26687 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,53■□□□□ 0,4
Twist1P26687 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,52■□□□□ 0,4
Twist1P26687 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17,52■□□□□ 0,4
Twist1P26687 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,52■□□□□ 0,39
Twist1P26687 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,52■□□□□ 0,39
Twist1P26687 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,51■□□□□ 0,39
Twist1P26687 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,51■□□□□ 0,39
Twist1P26687 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,5■□□□□ 0,39
Twist1P26687 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17,5■□□□□ 0,39
Twist1P26687 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17,5■□□□□ 0,39
Twist1P26687 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17,5■□□□□ 0,39
Twist1P26687 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,5■□□□□ 0,39
Twist1P26687 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC17,49■□□□□ 0,39
Twist1P26687 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,49■□□□□ 0,39
Twist1P26687 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,49■□□□□ 0,39
Twist1P26687 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,49■□□□□ 0,39
Twist1P26687 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,49■□□□□ 0,39
Twist1P26687 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,49■□□□□ 0,39
Twist1P26687 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,49■□□□□ 0,39
Twist1P26687 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17,48■□□□□ 0,39
Twist1P26687 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,48■□□□□ 0,39
Twist1P26687 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17,48■□□□□ 0,39
Twist1P26687 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17,48■□□□□ 0,39
Twist1P26687 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,48■□□□□ 0,39
Twist1P26687 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,48■□□□□ 0,39
Twist1P26687 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,48■□□□□ 0,39
Twist1P26687 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,48■□□□□ 0,39
Twist1P26687 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,47■□□□□ 0,39
Twist1P26687 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17,47■□□□□ 0,39
Twist1P26687 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,47■□□□□ 0,39
Twist1P26687 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17,47■□□□□ 0,39
Twist1P26687 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,47■□□□□ 0,39
Twist1P26687 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,47■□□□□ 0,39
Twist1P26687 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,47■□□□□ 0,39
Twist1P26687 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17,46■□□□□ 0,39
Twist1P26687 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17,46■□□□□ 0,39
Twist1P26687 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17,46■□□□□ 0,39
Twist1P26687 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17,46■□□□□ 0,39
Twist1P26687 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17,46■□□□□ 0,39
Twist1P26687 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,46■□□□□ 0,39
Twist1P26687 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17,45■□□□□ 0,38
Twist1P26687 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17,45■□□□□ 0,38
Twist1P26687 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,45■□□□□ 0,38
Twist1P26687 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC17,45■□□□□ 0,38
Twist1P26687 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,45■□□□□ 0,38
Twist1P26687 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,44■□□□□ 0,38
Twist1P26687 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC17,44■□□□□ 0,38
Twist1P26687 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17,44■□□□□ 0,38
Twist1P26687 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17,44■□□□□ 0,38
Twist1P26687 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,43■□□□□ 0,38
Twist1P26687 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17,43■□□□□ 0,38
Twist1P26687 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,43■□□□□ 0,38
Twist1P26687 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17,43■□□□□ 0,38
Twist1P26687 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17,43■□□□□ 0,38
Twist1P26687 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17,42■□□□□ 0,38
Twist1P26687 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC17,42■□□□□ 0,38
Twist1P26687 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,42■□□□□ 0,38
Twist1P26687 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,42■□□□□ 0,38
Twist1P26687 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC17,42■□□□□ 0,38
Twist1P26687 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,42■□□□□ 0,38
Twist1P26687 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,41■□□□□ 0,38
Twist1P26687 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17,41■□□□□ 0,38
Twist1P26687 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,41■□□□□ 0,38
Twist1P26687 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,41■□□□□ 0,38
Twist1P26687 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17,41■□□□□ 0,38
Twist1P26687 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,4■□□□□ 0,38
Twist1P26687 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,4■□□□□ 0,38
Twist1P26687 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,4■□□□□ 0,38
Twist1P26687 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17,4■□□□□ 0,38
Twist1P26687 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17,4■□□□□ 0,38
Twist1P26687 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,4■□□□□ 0,38
Twist1P26687 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,39■□□□□ 0,38
Twist1P26687 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17,39■□□□□ 0,38
Twist1P26687 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC17,39■□□□□ 0,37
Twist1P26687 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17,39■□□□□ 0,37
Twist1P26687 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17,39■□□□□ 0,37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21,9 ms