Protein–RNA interactions for Protein: P26369

U2af2, Splicing factor U2AF 65 kDa subunit, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2af2P26369 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
U2af2P26369 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
U2af2P26369 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
U2af2P26369 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
U2af2P26369 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
U2af2P26369 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
U2af2P26369 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
U2af2P26369 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
U2af2P26369 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
U2af2P26369 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
U2af2P26369 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
U2af2P26369 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
U2af2P26369 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
U2af2P26369 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
U2af2P26369 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
U2af2P26369 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
U2af2P26369 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
U2af2P26369 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
U2af2P26369 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
U2af2P26369 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
U2af2P26369 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
U2af2P26369 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
U2af2P26369 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
U2af2P26369 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
U2af2P26369 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
U2af2P26369 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
U2af2P26369 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
U2af2P26369 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
U2af2P26369 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
U2af2P26369 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
U2af2P26369 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
U2af2P26369 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
U2af2P26369 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
U2af2P26369 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
U2af2P26369 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
U2af2P26369 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
U2af2P26369 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
U2af2P26369 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
U2af2P26369 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
U2af2P26369 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
U2af2P26369 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
U2af2P26369 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
U2af2P26369 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
U2af2P26369 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
U2af2P26369 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
U2af2P26369 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
U2af2P26369 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
U2af2P26369 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
U2af2P26369 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
U2af2P26369 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
U2af2P26369 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
U2af2P26369 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
U2af2P26369 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
U2af2P26369 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
U2af2P26369 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
U2af2P26369 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
U2af2P26369 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
U2af2P26369 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
U2af2P26369 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
U2af2P26369 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
U2af2P26369 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
U2af2P26369 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
U2af2P26369 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
U2af2P26369 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
U2af2P26369 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
U2af2P26369 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
U2af2P26369 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
U2af2P26369 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
U2af2P26369 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
U2af2P26369 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
U2af2P26369 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
U2af2P26369 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
U2af2P26369 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
U2af2P26369 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
U2af2P26369 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
U2af2P26369 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
U2af2P26369 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
U2af2P26369 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
U2af2P26369 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
U2af2P26369 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
U2af2P26369 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
U2af2P26369 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
U2af2P26369 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
U2af2P26369 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
U2af2P26369 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
U2af2P26369 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
U2af2P26369 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
U2af2P26369 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
U2af2P26369 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
U2af2P26369 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
U2af2P26369 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
U2af2P26369 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
U2af2P26369 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
U2af2P26369 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
U2af2P26369 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
U2af2P26369 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
U2af2P26369 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
U2af2P26369 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
U2af2P26369 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
U2af2P26369 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.9 ms