Protein–RNA interactions for Protein: P26339

Chga, Chromogranin-A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChgaP26339 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ChgaP26339 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ChgaP26339 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
ChgaP26339 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ChgaP26339 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
ChgaP26339 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
ChgaP26339 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
ChgaP26339 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ChgaP26339 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ChgaP26339 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
ChgaP26339 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ChgaP26339 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ChgaP26339 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
ChgaP26339 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ChgaP26339 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ChgaP26339 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ChgaP26339 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ChgaP26339 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
ChgaP26339 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ChgaP26339 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
ChgaP26339 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ChgaP26339 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ChgaP26339 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ChgaP26339 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
ChgaP26339 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
ChgaP26339 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ChgaP26339 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ChgaP26339 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
ChgaP26339 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
ChgaP26339 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
ChgaP26339 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
ChgaP26339 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ChgaP26339 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ChgaP26339 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
ChgaP26339 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
ChgaP26339 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
ChgaP26339 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
ChgaP26339 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ChgaP26339 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ChgaP26339 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
ChgaP26339 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ChgaP26339 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ChgaP26339 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ChgaP26339 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ChgaP26339 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
ChgaP26339 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
ChgaP26339 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
ChgaP26339 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ChgaP26339 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ChgaP26339 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
ChgaP26339 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ChgaP26339 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ChgaP26339 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
ChgaP26339 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ChgaP26339 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ChgaP26339 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ChgaP26339 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
ChgaP26339 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ChgaP26339 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
ChgaP26339 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ChgaP26339 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ChgaP26339 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
ChgaP26339 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
ChgaP26339 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
ChgaP26339 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ChgaP26339 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ChgaP26339 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
ChgaP26339 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
ChgaP26339 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ChgaP26339 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ChgaP26339 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ChgaP26339 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ChgaP26339 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ChgaP26339 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
ChgaP26339 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ChgaP26339 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
ChgaP26339 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ChgaP26339 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
ChgaP26339 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ChgaP26339 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ChgaP26339 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ChgaP26339 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
ChgaP26339 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ChgaP26339 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
ChgaP26339 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ChgaP26339 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
ChgaP26339 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
ChgaP26339 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ChgaP26339 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
ChgaP26339 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
ChgaP26339 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ChgaP26339 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
ChgaP26339 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ChgaP26339 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
ChgaP26339 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
ChgaP26339 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
ChgaP26339 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ChgaP26339 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
ChgaP26339 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
ChgaP26339 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms