Protein–RNA interactions for Protein: P25801

Lmo2, Rhombotin-2, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmo2P25801 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmo2P25801 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmo2P25801 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Lmo2P25801 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lmo2P25801 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lmo2P25801 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lmo2P25801 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lmo2P25801 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Lmo2P25801 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lmo2P25801 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Lmo2P25801 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmo2P25801 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmo2P25801 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmo2P25801 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmo2P25801 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmo2P25801 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Lmo2P25801 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmo2P25801 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmo2P25801 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Lmo2P25801 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmo2P25801 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmo2P25801 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmo2P25801 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Lmo2P25801 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmo2P25801 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmo2P25801 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmo2P25801 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmo2P25801 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Lmo2P25801 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lmo2P25801 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Lmo2P25801 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Lmo2P25801 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Lmo2P25801 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Lmo2P25801 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Lmo2P25801 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmo2P25801 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmo2P25801 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmo2P25801 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Lmo2P25801 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lmo2P25801 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lmo2P25801 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lmo2P25801 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Lmo2P25801 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lmo2P25801 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lmo2P25801 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Lmo2P25801 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmo2P25801 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmo2P25801 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmo2P25801 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmo2P25801 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmo2P25801 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmo2P25801 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmo2P25801 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmo2P25801 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmo2P25801 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmo2P25801 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Lmo2P25801 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lmo2P25801 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lmo2P25801 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lmo2P25801 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lmo2P25801 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Lmo2P25801 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lmo2P25801 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lmo2P25801 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lmo2P25801 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lmo2P25801 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lmo2P25801 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lmo2P25801 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lmo2P25801 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lmo2P25801 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lmo2P25801 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Lmo2P25801 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lmo2P25801 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lmo2P25801 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Lmo2P25801 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lmo2P25801 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lmo2P25801 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lmo2P25801 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Lmo2P25801 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Lmo2P25801 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lmo2P25801 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lmo2P25801 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Lmo2P25801 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lmo2P25801 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Lmo2P25801 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lmo2P25801 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lmo2P25801 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lmo2P25801 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lmo2P25801 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Lmo2P25801 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lmo2P25801 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lmo2P25801 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lmo2P25801 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lmo2P25801 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lmo2P25801 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Lmo2P25801 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lmo2P25801 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lmo2P25801 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lmo2P25801 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Lmo2P25801 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms