Protein–RNA interactions for Protein: P23813

Hoxd11, Homeobox protein Hox-D11, mousemouse

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Length 323 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd11P23813 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC27,27■■□□□ 1,96
Hoxd11P23813 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,27■■□□□ 1,96
Hoxd11P23813 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,25■■□□□ 1,95
Hoxd11P23813 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC27,24■■□□□ 1,95
Hoxd11P23813 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Hoxd11P23813 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,23■■□□□ 1,95
Hoxd11P23813 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC27,22■■□□□ 1,95
Hoxd11P23813 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Hoxd11P23813 2610203C22Rik-201ENSMUST00000115480 1246 ntTSL 1 (best) BASIC27,22■■□□□ 1,95
Hoxd11P23813 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC27,21■■□□□ 1,95
Hoxd11P23813 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC27,21■■□□□ 1,95
Hoxd11P23813 2900076G11Rik-201ENSMUST00000202297 631 ntBASIC27,2■■□□□ 1,94
Hoxd11P23813 AC132260.2-201ENSMUST00000224482 344 ntBASIC27,2■■□□□ 1,94
Hoxd11P23813 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC27,2■■□□□ 1,94
Hoxd11P23813 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,2■■□□□ 1,94
Hoxd11P23813 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Hoxd11P23813 Gm29019-202ENSMUST00000188623 564 ntTSL 2 BASIC27,18■■□□□ 1,94
Hoxd11P23813 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC27,18■■□□□ 1,94
Hoxd11P23813 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Hoxd11P23813 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC27,17■■□□□ 1,94
Hoxd11P23813 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Hoxd11P23813 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27,17■■□□□ 1,94
Hoxd11P23813 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Hoxd11P23813 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC27,16■■□□□ 1,94
Hoxd11P23813 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,16■■□□□ 1,94
Hoxd11P23813 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27,16■■□□□ 1,94
Hoxd11P23813 4930483J18Rik-202ENSMUST00000138715 1093 ntTSL 1 (best) BASIC27,15■■□□□ 1,94
Hoxd11P23813 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC27,15■■□□□ 1,94
Hoxd11P23813 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC27,15■■□□□ 1,94
Hoxd11P23813 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,15■■□□□ 1,94
Hoxd11P23813 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,14■■□□□ 1,94
Hoxd11P23813 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC27,14■■□□□ 1,94
Hoxd11P23813 Gm43974-201ENSMUST00000205080 684 ntBASIC27,13■■□□□ 1,93
Hoxd11P23813 Gm45696-201ENSMUST00000212088 985 ntBASIC27,13■■□□□ 1,93
Hoxd11P23813 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,13■■□□□ 1,93
Hoxd11P23813 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Hoxd11P23813 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27,12■■□□□ 1,93
Hoxd11P23813 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC27,12■■□□□ 1,93
Hoxd11P23813 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,12■■□□□ 1,93
Hoxd11P23813 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Hoxd11P23813 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,11■■□□□ 1,93
Hoxd11P23813 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,1■■□□□ 1,93
Hoxd11P23813 Gm15952-202ENSMUST00000144542 556 ntTSL 3 BASIC27,1■■□□□ 1,93
Hoxd11P23813 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,1■■□□□ 1,93
Hoxd11P23813 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,1■■□□□ 1,93
Hoxd11P23813 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Hoxd11P23813 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Hoxd11P23813 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Hoxd11P23813 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC27,09■■□□□ 1,93
Hoxd11P23813 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,09■■□□□ 1,93
Hoxd11P23813 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Hoxd11P23813 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC27,08■■□□□ 1,93
Hoxd11P23813 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,08■■□□□ 1,93
Hoxd11P23813 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Hoxd11P23813 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Hoxd11P23813 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC27,07■■□□□ 1,92
Hoxd11P23813 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC27,07■■□□□ 1,92
Hoxd11P23813 Cklf-210ENSMUST00000212939 737 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27,07■■□□□ 1,92
Hoxd11P23813 Gm17872-201ENSMUST00000222550 532 ntBASIC27,07■■□□□ 1,92
Hoxd11P23813 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC27,07■■□□□ 1,92
Hoxd11P23813 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC27,07■■□□□ 1,92
Hoxd11P23813 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Hoxd11P23813 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC27,06■■□□□ 1,92
Hoxd11P23813 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC27,06■■□□□ 1,92
Hoxd11P23813 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,06■■□□□ 1,92
Hoxd11P23813 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC27,05■■□□□ 1,92
Hoxd11P23813 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,05■■□□□ 1,92
Hoxd11P23813 Gm12849-201ENSMUST00000120013 739 ntBASIC27,04■■□□□ 1,92
Hoxd11P23813 Gm14363-201ENSMUST00000122304 409 ntBASIC27,04■■□□□ 1,92
Hoxd11P23813 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC27,04■■□□□ 1,92
Hoxd11P23813 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,04■■□□□ 1,92
Hoxd11P23813 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Hoxd11P23813 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Hoxd11P23813 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27,03■■□□□ 1,92
Hoxd11P23813 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Hoxd11P23813 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,03■■□□□ 1,92
Hoxd11P23813 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC27,02■■□□□ 1,92
Hoxd11P23813 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Hoxd11P23813 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,02■■□□□ 1,92
Hoxd11P23813 Gm28877-201ENSMUST00000191349 604 ntBASIC27,02■■□□□ 1,92
Hoxd11P23813 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC27,02■■□□□ 1,92
Hoxd11P23813 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,02■■□□□ 1,92
Hoxd11P23813 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27,02■■□□□ 1,92
Hoxd11P23813 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC27,01■■□□□ 1,91
Hoxd11P23813 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27,01■■□□□ 1,91
Hoxd11P23813 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1,91
Hoxd11P23813 Gm28745-201ENSMUST00000190069 305 ntBASIC27■■□□□ 1,91
Hoxd11P23813 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Hoxd11P23813 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Hoxd11P23813 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Hoxd11P23813 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Hoxd11P23813 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1,91
Hoxd11P23813 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26,99■■□□□ 1,91
Hoxd11P23813 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26,98■■□□□ 1,91
Hoxd11P23813 Gm44953-201ENSMUST00000208745 1286 ntBASIC26,98■■□□□ 1,91
Hoxd11P23813 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC26,98■■□□□ 1,91
Hoxd11P23813 AC154248.2-201ENSMUST00000221964 659 ntTSL 5 BASIC26,98■■□□□ 1,91
Hoxd11P23813 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26,97■■□□□ 1,91
Hoxd11P23813 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26,97■■□□□ 1,91
Hoxd11P23813 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26,97■■□□□ 1,91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30,6 ms