Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tsta3P23591 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Tsta3P23591 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tsta3P23591 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tsta3P23591 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tsta3P23591 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tsta3P23591 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tsta3P23591 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tsta3P23591 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tsta3P23591 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tsta3P23591 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tsta3P23591 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tsta3P23591 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tsta3P23591 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tsta3P23591 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tsta3P23591 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tsta3P23591 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tsta3P23591 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tsta3P23591 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Tsta3P23591 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tsta3P23591 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tsta3P23591 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tsta3P23591 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tsta3P23591 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tsta3P23591 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tsta3P23591 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tsta3P23591 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tsta3P23591 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tsta3P23591 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tsta3P23591 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tsta3P23591 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tsta3P23591 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tsta3P23591 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tsta3P23591 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tsta3P23591 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tsta3P23591 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tsta3P23591 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tsta3P23591 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Tsta3P23591 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tsta3P23591 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Tsta3P23591 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tsta3P23591 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Tsta3P23591 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tsta3P23591 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tsta3P23591 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tsta3P23591 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tsta3P23591 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tsta3P23591 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tsta3P23591 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tsta3P23591 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tsta3P23591 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Tsta3P23591 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tsta3P23591 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tsta3P23591 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tsta3P23591 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tsta3P23591 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tsta3P23591 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tsta3P23591 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tsta3P23591 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tsta3P23591 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tsta3P23591 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tsta3P23591 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tsta3P23591 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tsta3P23591 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tsta3P23591 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tsta3P23591 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tsta3P23591 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tsta3P23591 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Tsta3P23591 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tsta3P23591 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tsta3P23591 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tsta3P23591 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tsta3P23591 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tsta3P23591 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tsta3P23591 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tsta3P23591 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tsta3P23591 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tsta3P23591 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tsta3P23591 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tsta3P23591 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tsta3P23591 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tsta3P23591 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tsta3P23591 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tsta3P23591 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tsta3P23591 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tsta3P23591 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tsta3P23591 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tsta3P23591 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tsta3P23591 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tsta3P23591 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tsta3P23591 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tsta3P23591 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tsta3P23591 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tsta3P23591 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tsta3P23591 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tsta3P23591 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tsta3P23591 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tsta3P23591 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tsta3P23591 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tsta3P23591 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms