Protein–RNA interactions for Protein: P19437

Ms4a1, B-lymphocyte antigen CD20, mousemouse

Predictions only

Length 291 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a1P19437 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ms4a1P19437 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ms4a1P19437 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ms4a1P19437 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ms4a1P19437 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ms4a1P19437 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Ms4a1P19437 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ms4a1P19437 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ms4a1P19437 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ms4a1P19437 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ms4a1P19437 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ms4a1P19437 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ms4a1P19437 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
Ms4a1P19437 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Ms4a1P19437 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ms4a1P19437 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Ms4a1P19437 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ms4a1P19437 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ms4a1P19437 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ms4a1P19437 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ms4a1P19437 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ms4a1P19437 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ms4a1P19437 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ms4a1P19437 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ms4a1P19437 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ms4a1P19437 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ms4a1P19437 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ms4a1P19437 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ms4a1P19437 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ms4a1P19437 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ms4a1P19437 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ms4a1P19437 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ms4a1P19437 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ms4a1P19437 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ms4a1P19437 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ms4a1P19437 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ms4a1P19437 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ms4a1P19437 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ms4a1P19437 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ms4a1P19437 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ms4a1P19437 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ms4a1P19437 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ms4a1P19437 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ms4a1P19437 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ms4a1P19437 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ms4a1P19437 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ms4a1P19437 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ms4a1P19437 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ms4a1P19437 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ms4a1P19437 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ms4a1P19437 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ms4a1P19437 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ms4a1P19437 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ms4a1P19437 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ms4a1P19437 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ms4a1P19437 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ms4a1P19437 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ms4a1P19437 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ms4a1P19437 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ms4a1P19437 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ms4a1P19437 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ms4a1P19437 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ms4a1P19437 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ms4a1P19437 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Ms4a1P19437 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ms4a1P19437 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ms4a1P19437 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ms4a1P19437 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ms4a1P19437 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ms4a1P19437 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ms4a1P19437 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ms4a1P19437 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ms4a1P19437 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ms4a1P19437 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ms4a1P19437 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ms4a1P19437 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ms4a1P19437 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ms4a1P19437 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ms4a1P19437 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ms4a1P19437 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Ms4a1P19437 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ms4a1P19437 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ms4a1P19437 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ms4a1P19437 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ms4a1P19437 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ms4a1P19437 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Ms4a1P19437 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ms4a1P19437 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ms4a1P19437 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ms4a1P19437 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ms4a1P19437 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ms4a1P19437 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ms4a1P19437 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ms4a1P19437 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ms4a1P19437 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ms4a1P19437 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ms4a1P19437 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ms4a1P19437 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ms4a1P19437 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ms4a1P19437 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms