Protein–RNA interactions for Protein: P18654

Rps6ka3, Ribosomal protein S6 kinase alpha-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka3P18654 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rps6ka3P18654 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rps6ka3P18654 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rps6ka3P18654 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rps6ka3P18654 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rps6ka3P18654 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rps6ka3P18654 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rps6ka3P18654 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rps6ka3P18654 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rps6ka3P18654 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rps6ka3P18654 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rps6ka3P18654 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rps6ka3P18654 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rps6ka3P18654 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rps6ka3P18654 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rps6ka3P18654 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rps6ka3P18654 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rps6ka3P18654 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rps6ka3P18654 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rps6ka3P18654 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rps6ka3P18654 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Rps6ka3P18654 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rps6ka3P18654 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rps6ka3P18654 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rps6ka3P18654 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rps6ka3P18654 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rps6ka3P18654 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rps6ka3P18654 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rps6ka3P18654 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rps6ka3P18654 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rps6ka3P18654 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rps6ka3P18654 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rps6ka3P18654 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rps6ka3P18654 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rps6ka3P18654 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rps6ka3P18654 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rps6ka3P18654 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rps6ka3P18654 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rps6ka3P18654 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Rps6ka3P18654 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rps6ka3P18654 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rps6ka3P18654 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rps6ka3P18654 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rps6ka3P18654 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rps6ka3P18654 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rps6ka3P18654 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rps6ka3P18654 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rps6ka3P18654 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rps6ka3P18654 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rps6ka3P18654 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rps6ka3P18654 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rps6ka3P18654 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rps6ka3P18654 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rps6ka3P18654 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rps6ka3P18654 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rps6ka3P18654 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rps6ka3P18654 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rps6ka3P18654 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rps6ka3P18654 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rps6ka3P18654 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rps6ka3P18654 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rps6ka3P18654 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rps6ka3P18654 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rps6ka3P18654 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rps6ka3P18654 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rps6ka3P18654 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rps6ka3P18654 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rps6ka3P18654 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rps6ka3P18654 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rps6ka3P18654 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rps6ka3P18654 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rps6ka3P18654 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rps6ka3P18654 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rps6ka3P18654 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rps6ka3P18654 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rps6ka3P18654 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rps6ka3P18654 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Rps6ka3P18654 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rps6ka3P18654 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rps6ka3P18654 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rps6ka3P18654 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rps6ka3P18654 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rps6ka3P18654 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rps6ka3P18654 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rps6ka3P18654 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rps6ka3P18654 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rps6ka3P18654 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rps6ka3P18654 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rps6ka3P18654 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rps6ka3P18654 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rps6ka3P18654 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rps6ka3P18654 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rps6ka3P18654 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rps6ka3P18654 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rps6ka3P18654 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rps6ka3P18654 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rps6ka3P18654 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rps6ka3P18654 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Rps6ka3P18654 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Rps6ka3P18654 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms