Protein–RNA interactions for Protein: P18533

Ig heavy chain V region 733, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18533 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
P18533 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
P18533 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
P18533 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
P18533 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
P18533 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
P18533 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
P18533 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
P18533 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
P18533 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
P18533 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
P18533 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
P18533 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
P18533 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
P18533 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
P18533 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
P18533 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
P18533 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
P18533 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
P18533 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
P18533 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
P18533 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
P18533 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
P18533 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
P18533 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
P18533 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
P18533 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
P18533 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
P18533 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
P18533 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
P18533 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
P18533 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
P18533 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
P18533 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
P18533 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
P18533 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
P18533 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
P18533 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
P18533 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
P18533 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
P18533 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
P18533 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
P18533 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
P18533 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
P18533 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
P18533 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
P18533 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
P18533 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
P18533 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
P18533 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
P18533 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
P18533 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
P18533 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P18533 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P18533 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
P18533 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
P18533 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P18533 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P18533 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
P18533 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P18533 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P18533 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
P18533 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
P18533 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
P18533 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
P18533 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
P18533 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
P18533 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
P18533 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
P18533 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
P18533 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P18533 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
P18533 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
P18533 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
P18533 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P18533 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P18533 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P18533 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P18533 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
P18533 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
P18533 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
P18533 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
P18533 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
P18533 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P18533 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P18533 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
P18533 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
P18533 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P18533 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P18533 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P18533 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
P18533 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
P18533 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P18533 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
P18533 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
P18533 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
P18533 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P18533 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
P18533 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
P18533 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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