Protein–RNA interactions for Protein: P15331

Prph, Peripherin, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrphP15331 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PrphP15331 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PrphP15331 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PrphP15331 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PrphP15331 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PrphP15331 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PrphP15331 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PrphP15331 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PrphP15331 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PrphP15331 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PrphP15331 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PrphP15331 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PrphP15331 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PrphP15331 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PrphP15331 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PrphP15331 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PrphP15331 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PrphP15331 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PrphP15331 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PrphP15331 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PrphP15331 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PrphP15331 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PrphP15331 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PrphP15331 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PrphP15331 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PrphP15331 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PrphP15331 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PrphP15331 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PrphP15331 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PrphP15331 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PrphP15331 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PrphP15331 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PrphP15331 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PrphP15331 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PrphP15331 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PrphP15331 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PrphP15331 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PrphP15331 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PrphP15331 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PrphP15331 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PrphP15331 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PrphP15331 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PrphP15331 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PrphP15331 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PrphP15331 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PrphP15331 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PrphP15331 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PrphP15331 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PrphP15331 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PrphP15331 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PrphP15331 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PrphP15331 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PrphP15331 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PrphP15331 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PrphP15331 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PrphP15331 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PrphP15331 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PrphP15331 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PrphP15331 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PrphP15331 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PrphP15331 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PrphP15331 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PrphP15331 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PrphP15331 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PrphP15331 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PrphP15331 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PrphP15331 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PrphP15331 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PrphP15331 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PrphP15331 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PrphP15331 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PrphP15331 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PrphP15331 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PrphP15331 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PrphP15331 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PrphP15331 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PrphP15331 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PrphP15331 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PrphP15331 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PrphP15331 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PrphP15331 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PrphP15331 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PrphP15331 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PrphP15331 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PrphP15331 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PrphP15331 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PrphP15331 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PrphP15331 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PrphP15331 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PrphP15331 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PrphP15331 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PrphP15331 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PrphP15331 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PrphP15331 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PrphP15331 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PrphP15331 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PrphP15331 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PrphP15331 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PrphP15331 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PrphP15331 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms