Protein–RNA interactions for Protein: P13439

Umps, Uridine 5'-monophosphate synthase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UmpsP13439 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UmpsP13439 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UmpsP13439 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UmpsP13439 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UmpsP13439 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UmpsP13439 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UmpsP13439 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UmpsP13439 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UmpsP13439 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UmpsP13439 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UmpsP13439 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UmpsP13439 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UmpsP13439 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UmpsP13439 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UmpsP13439 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UmpsP13439 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UmpsP13439 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UmpsP13439 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UmpsP13439 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UmpsP13439 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UmpsP13439 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UmpsP13439 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
UmpsP13439 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UmpsP13439 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UmpsP13439 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UmpsP13439 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UmpsP13439 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UmpsP13439 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UmpsP13439 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UmpsP13439 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UmpsP13439 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
UmpsP13439 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UmpsP13439 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
UmpsP13439 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UmpsP13439 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UmpsP13439 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UmpsP13439 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UmpsP13439 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UmpsP13439 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
UmpsP13439 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UmpsP13439 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UmpsP13439 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
UmpsP13439 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
UmpsP13439 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
UmpsP13439 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UmpsP13439 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UmpsP13439 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
UmpsP13439 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
UmpsP13439 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UmpsP13439 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
UmpsP13439 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UmpsP13439 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UmpsP13439 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
UmpsP13439 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UmpsP13439 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UmpsP13439 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UmpsP13439 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
UmpsP13439 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UmpsP13439 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UmpsP13439 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
UmpsP13439 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
UmpsP13439 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UmpsP13439 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UmpsP13439 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
UmpsP13439 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UmpsP13439 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UmpsP13439 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UmpsP13439 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
UmpsP13439 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UmpsP13439 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UmpsP13439 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UmpsP13439 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
UmpsP13439 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UmpsP13439 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
UmpsP13439 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
UmpsP13439 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UmpsP13439 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UmpsP13439 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
UmpsP13439 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UmpsP13439 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UmpsP13439 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UmpsP13439 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UmpsP13439 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UmpsP13439 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
UmpsP13439 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
UmpsP13439 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UmpsP13439 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
UmpsP13439 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UmpsP13439 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UmpsP13439 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UmpsP13439 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
UmpsP13439 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UmpsP13439 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UmpsP13439 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
UmpsP13439 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UmpsP13439 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UmpsP13439 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
UmpsP13439 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
UmpsP13439 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
UmpsP13439 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 102 ms