Protein–RNA interactions for Protein: P13346

Fosb, Protein fosB, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FosbP13346 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
FosbP13346 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FosbP13346 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
FosbP13346 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FosbP13346 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FosbP13346 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FosbP13346 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FosbP13346 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FosbP13346 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FosbP13346 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FosbP13346 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FosbP13346 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FosbP13346 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FosbP13346 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
FosbP13346 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
FosbP13346 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FosbP13346 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FosbP13346 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FosbP13346 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FosbP13346 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FosbP13346 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FosbP13346 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
FosbP13346 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
FosbP13346 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FosbP13346 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FosbP13346 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FosbP13346 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FosbP13346 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FosbP13346 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FosbP13346 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FosbP13346 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FosbP13346 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FosbP13346 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FosbP13346 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FosbP13346 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FosbP13346 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FosbP13346 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FosbP13346 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FosbP13346 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
FosbP13346 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FosbP13346 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FosbP13346 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FosbP13346 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FosbP13346 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FosbP13346 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FosbP13346 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FosbP13346 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FosbP13346 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FosbP13346 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FosbP13346 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
FosbP13346 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FosbP13346 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FosbP13346 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FosbP13346 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FosbP13346 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
FosbP13346 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FosbP13346 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FosbP13346 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FosbP13346 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FosbP13346 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FosbP13346 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FosbP13346 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FosbP13346 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FosbP13346 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FosbP13346 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
FosbP13346 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FosbP13346 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FosbP13346 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FosbP13346 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FosbP13346 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FosbP13346 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FosbP13346 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FosbP13346 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
FosbP13346 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FosbP13346 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
FosbP13346 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
FosbP13346 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FosbP13346 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FosbP13346 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FosbP13346 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FosbP13346 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FosbP13346 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FosbP13346 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FosbP13346 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FosbP13346 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FosbP13346 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FosbP13346 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FosbP13346 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FosbP13346 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FosbP13346 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
FosbP13346 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
FosbP13346 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
FosbP13346 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FosbP13346 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FosbP13346 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FosbP13346 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FosbP13346 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FosbP13346 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FosbP13346 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FosbP13346 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms