Protein–RNA interactions for Protein: P11688

Itga5, Integrin alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 1,053 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga5P11688 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Itga5P11688 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Itga5P11688 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Itga5P11688 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Itga5P11688 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Itga5P11688 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Itga5P11688 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Itga5P11688 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Itga5P11688 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Itga5P11688 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Itga5P11688 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Itga5P11688 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Itga5P11688 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Itga5P11688 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Itga5P11688 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Itga5P11688 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Itga5P11688 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Itga5P11688 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Itga5P11688 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Itga5P11688 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Itga5P11688 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Itga5P11688 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Itga5P11688 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Itga5P11688 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Itga5P11688 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Itga5P11688 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Itga5P11688 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Itga5P11688 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Itga5P11688 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Itga5P11688 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Itga5P11688 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Itga5P11688 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Itga5P11688 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Itga5P11688 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Itga5P11688 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Itga5P11688 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Itga5P11688 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Itga5P11688 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Itga5P11688 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Itga5P11688 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Itga5P11688 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Itga5P11688 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Itga5P11688 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Itga5P11688 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Itga5P11688 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itga5P11688 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itga5P11688 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itga5P11688 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itga5P11688 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itga5P11688 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Itga5P11688 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itga5P11688 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Itga5P11688 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itga5P11688 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itga5P11688 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itga5P11688 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itga5P11688 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itga5P11688 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Itga5P11688 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Itga5P11688 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itga5P11688 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itga5P11688 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itga5P11688 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Itga5P11688 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itga5P11688 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itga5P11688 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itga5P11688 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Itga5P11688 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Itga5P11688 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itga5P11688 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itga5P11688 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Itga5P11688 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Itga5P11688 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Itga5P11688 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Itga5P11688 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itga5P11688 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Itga5P11688 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itga5P11688 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itga5P11688 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itga5P11688 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itga5P11688 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itga5P11688 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Itga5P11688 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itga5P11688 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itga5P11688 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Itga5P11688 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itga5P11688 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itga5P11688 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itga5P11688 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Itga5P11688 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itga5P11688 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itga5P11688 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itga5P11688 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Itga5P11688 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itga5P11688 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itga5P11688 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itga5P11688 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itga5P11688 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Itga5P11688 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Itga5P11688 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms