Protein–RNA interactions for Protein: P0DP27

Calm2, Calmodulin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calm2P0DP27 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Calm2P0DP27 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Calm2P0DP27 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Calm2P0DP27 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Calm2P0DP27 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Calm2P0DP27 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Calm2P0DP27 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Calm2P0DP27 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Calm2P0DP27 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Calm2P0DP27 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Calm2P0DP27 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Calm2P0DP27 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Calm2P0DP27 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Calm2P0DP27 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Calm2P0DP27 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Calm2P0DP27 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Calm2P0DP27 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Calm2P0DP27 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Calm2P0DP27 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Calm2P0DP27 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Calm2P0DP27 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Calm2P0DP27 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Calm2P0DP27 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Calm2P0DP27 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Calm2P0DP27 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Calm2P0DP27 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Calm2P0DP27 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Calm2P0DP27 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Calm2P0DP27 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Calm2P0DP27 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Calm2P0DP27 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Calm2P0DP27 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Calm2P0DP27 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Calm2P0DP27 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Calm2P0DP27 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Calm2P0DP27 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Calm2P0DP27 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Calm2P0DP27 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Calm2P0DP27 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Calm2P0DP27 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Calm2P0DP27 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Calm2P0DP27 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Calm2P0DP27 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Calm2P0DP27 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Calm2P0DP27 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Calm2P0DP27 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Calm2P0DP27 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Calm2P0DP27 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Calm2P0DP27 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Calm2P0DP27 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Calm2P0DP27 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Calm2P0DP27 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Calm2P0DP27 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Calm2P0DP27 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Calm2P0DP27 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Calm2P0DP27 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Calm2P0DP27 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Calm2P0DP27 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Calm2P0DP27 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Calm2P0DP27 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Calm2P0DP27 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Calm2P0DP27 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Calm2P0DP27 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Calm2P0DP27 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Calm2P0DP27 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Calm2P0DP27 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Calm2P0DP27 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Calm2P0DP27 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Calm2P0DP27 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Calm2P0DP27 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Calm2P0DP27 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Calm2P0DP27 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Calm2P0DP27 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Calm2P0DP27 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Calm2P0DP27 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Calm2P0DP27 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Calm2P0DP27 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Calm2P0DP27 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Calm2P0DP27 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Calm2P0DP27 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Calm2P0DP27 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Calm2P0DP27 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Calm2P0DP27 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Calm2P0DP27 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Calm2P0DP27 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Calm2P0DP27 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Calm2P0DP27 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Calm2P0DP27 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Calm2P0DP27 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Calm2P0DP27 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Calm2P0DP27 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Calm2P0DP27 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Calm2P0DP27 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Calm2P0DP27 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Calm2P0DP27 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Calm2P0DP27 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Calm2P0DP27 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Calm2P0DP27 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Calm2P0DP27 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Calm2P0DP27 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms