Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
NefmP08553 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
NefmP08553 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
NefmP08553 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NefmP08553 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NefmP08553 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.62■■■□□ 2.97
NefmP08553 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
NefmP08553 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NefmP08553 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NefmP08553 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NefmP08553 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NefmP08553 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NefmP08553 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NefmP08553 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NefmP08553 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.58■■■□□ 2.97
NefmP08553 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
NefmP08553 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
NefmP08553 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
NefmP08553 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
NefmP08553 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
NefmP08553 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NefmP08553 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NefmP08553 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NefmP08553 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NefmP08553 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NefmP08553 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
NefmP08553 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
NefmP08553 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
NefmP08553 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC33.53■■■□□ 2.96
NefmP08553 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NefmP08553 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC33.53■■■□□ 2.96
NefmP08553 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
NefmP08553 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
NefmP08553 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
NefmP08553 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
NefmP08553 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
NefmP08553 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NefmP08553 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC33.5■■■□□ 2.95
NefmP08553 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NefmP08553 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NefmP08553 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NefmP08553 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NefmP08553 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
NefmP08553 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
NefmP08553 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NefmP08553 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NefmP08553 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NefmP08553 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NefmP08553 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NefmP08553 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
NefmP08553 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NefmP08553 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
NefmP08553 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC33.46■■■□□ 2.95
NefmP08553 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
NefmP08553 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
NefmP08553 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
NefmP08553 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
NefmP08553 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
NefmP08553 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NefmP08553 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
NefmP08553 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NefmP08553 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NefmP08553 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
NefmP08553 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NefmP08553 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NefmP08553 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NefmP08553 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
NefmP08553 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NefmP08553 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
NefmP08553 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
NefmP08553 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
NefmP08553 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
NefmP08553 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
NefmP08553 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NefmP08553 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NefmP08553 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
NefmP08553 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC33.38■■■□□ 2.93
NefmP08553 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
NefmP08553 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.37■■■□□ 2.93
NefmP08553 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NefmP08553 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NefmP08553 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.36■■■□□ 2.93
NefmP08553 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
NefmP08553 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC33.36■■■□□ 2.93
NefmP08553 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
NefmP08553 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NefmP08553 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
NefmP08553 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
NefmP08553 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NefmP08553 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NefmP08553 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NefmP08553 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
NefmP08553 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NefmP08553 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NefmP08553 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC33.33■■■□□ 2.93
NefmP08553 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NefmP08553 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
NefmP08553 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
NefmP08553 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC33.32■■■□□ 2.92
NefmP08553 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms