Protein–RNA interactions for Protein: P06795

Abcb1b, Multidrug resistance protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcb1bP06795 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Abcb1bP06795 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Abcb1bP06795 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Abcb1bP06795 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Abcb1bP06795 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Abcb1bP06795 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Abcb1bP06795 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Abcb1bP06795 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Abcb1bP06795 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Abcb1bP06795 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Abcb1bP06795 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Abcb1bP06795 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Abcb1bP06795 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Abcb1bP06795 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Abcb1bP06795 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Abcb1bP06795 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcb1bP06795 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcb1bP06795 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcb1bP06795 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcb1bP06795 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcb1bP06795 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcb1bP06795 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcb1bP06795 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcb1bP06795 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcb1bP06795 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcb1bP06795 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Abcb1bP06795 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Abcb1bP06795 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Abcb1bP06795 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Abcb1bP06795 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Abcb1bP06795 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Abcb1bP06795 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Abcb1bP06795 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Abcb1bP06795 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Abcb1bP06795 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Abcb1bP06795 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Abcb1bP06795 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Abcb1bP06795 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Abcb1bP06795 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abcb1bP06795 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abcb1bP06795 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abcb1bP06795 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abcb1bP06795 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abcb1bP06795 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abcb1bP06795 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Abcb1bP06795 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Abcb1bP06795 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Abcb1bP06795 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Abcb1bP06795 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Abcb1bP06795 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abcb1bP06795 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Abcb1bP06795 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcb1bP06795 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcb1bP06795 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcb1bP06795 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcb1bP06795 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Abcb1bP06795 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abcb1bP06795 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abcb1bP06795 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Abcb1bP06795 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abcb1bP06795 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abcb1bP06795 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abcb1bP06795 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abcb1bP06795 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Abcb1bP06795 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Abcb1bP06795 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Abcb1bP06795 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Abcb1bP06795 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Abcb1bP06795 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Abcb1bP06795 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Abcb1bP06795 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Abcb1bP06795 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Abcb1bP06795 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Abcb1bP06795 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Abcb1bP06795 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Abcb1bP06795 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Abcb1bP06795 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Abcb1bP06795 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Abcb1bP06795 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Abcb1bP06795 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Abcb1bP06795 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Abcb1bP06795 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Abcb1bP06795 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Abcb1bP06795 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Abcb1bP06795 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Abcb1bP06795 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Abcb1bP06795 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Abcb1bP06795 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Abcb1bP06795 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Abcb1bP06795 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Abcb1bP06795 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Abcb1bP06795 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Abcb1bP06795 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Abcb1bP06795 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Abcb1bP06795 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Abcb1bP06795 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Abcb1bP06795 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Abcb1bP06795 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Abcb1bP06795 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Abcb1bP06795 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms