Protein–RNA interactions for Protein: P05977

Myl1, Myosin light chain 1/3, skeletal muscle isoform, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Myl1P05977 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Myl1P05977 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Myl1P05977 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Myl1P05977 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Myl1P05977 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Myl1P05977 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Myl1P05977 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Myl1P05977 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Myl1P05977 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Myl1P05977 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Myl1P05977 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Myl1P05977 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Myl1P05977 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Myl1P05977 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Myl1P05977 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Myl1P05977 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Myl1P05977 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Myl1P05977 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Myl1P05977 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Myl1P05977 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Myl1P05977 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Myl1P05977 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Myl1P05977 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Myl1P05977 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Myl1P05977 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Myl1P05977 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Myl1P05977 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Myl1P05977 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Myl1P05977 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Myl1P05977 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Myl1P05977 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Myl1P05977 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Myl1P05977 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Myl1P05977 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Myl1P05977 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Myl1P05977 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Myl1P05977 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Myl1P05977 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Myl1P05977 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Myl1P05977 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Myl1P05977 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Myl1P05977 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Myl1P05977 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Myl1P05977 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Myl1P05977 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Myl1P05977 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Myl1P05977 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Myl1P05977 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Myl1P05977 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Myl1P05977 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Myl1P05977 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Myl1P05977 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Myl1P05977 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Myl1P05977 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Myl1P05977 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Myl1P05977 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Myl1P05977 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Myl1P05977 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Myl1P05977 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Myl1P05977 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Myl1P05977 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Myl1P05977 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Myl1P05977 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Myl1P05977 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Myl1P05977 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Myl1P05977 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Myl1P05977 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Myl1P05977 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Myl1P05977 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Myl1P05977 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Myl1P05977 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Myl1P05977 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Myl1P05977 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Myl1P05977 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Myl1P05977 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Myl1P05977 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Myl1P05977 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Myl1P05977 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Myl1P05977 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Myl1P05977 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Myl1P05977 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Myl1P05977 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Myl1P05977 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Myl1P05977 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Myl1P05977 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Myl1P05977 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Myl1P05977 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Myl1P05977 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Myl1P05977 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Myl1P05977 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Myl1P05977 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Myl1P05977 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Myl1P05977 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Myl1P05977 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Myl1P05977 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Myl1P05977 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Myl1P05977 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Myl1P05977 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Myl1P05977 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Myl1P05977 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.1 ms