Protein–RNA interactions for Protein: P01896

H-2 class I histocompatibility antigen, alpha chain (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01896 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,15■□□□□ 0,18
P01896 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16,15■□□□□ 0,18
P01896 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,15■□□□□ 0,18
P01896 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,15■□□□□ 0,18
P01896 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,14■□□□□ 0,17
P01896 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,14■□□□□ 0,17
P01896 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,14■□□□□ 0,17
P01896 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,13■□□□□ 0,17
P01896 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,13■□□□□ 0,17
P01896 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,13■□□□□ 0,17
P01896 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16,13■□□□□ 0,17
P01896 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC16,13■□□□□ 0,17
P01896 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16,12■□□□□ 0,17
P01896 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,12■□□□□ 0,17
P01896 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,12■□□□□ 0,17
P01896 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,12■□□□□ 0,17
P01896 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC16,12■□□□□ 0,17
P01896 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,12■□□□□ 0,17
P01896 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC16,11■□□□□ 0,17
P01896 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,11■□□□□ 0,17
P01896 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,11■□□□□ 0,17
P01896 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16,11■□□□□ 0,17
P01896 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16,11■□□□□ 0,17
P01896 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,1■□□□□ 0,17
P01896 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16,1■□□□□ 0,17
P01896 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,1■□□□□ 0,17
P01896 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,1■□□□□ 0,17
P01896 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16,1■□□□□ 0,17
P01896 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,1■□□□□ 0,17
P01896 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16,1■□□□□ 0,17
P01896 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,1■□□□□ 0,17
P01896 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16,1■□□□□ 0,17
P01896 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,1■□□□□ 0,17
P01896 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,09■□□□□ 0,17
P01896 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,09■□□□□ 0,17
P01896 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,09■□□□□ 0,17
P01896 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC16,09■□□□□ 0,17
P01896 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,09■□□□□ 0,17
P01896 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16,09■□□□□ 0,17
P01896 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,09■□□□□ 0,17
P01896 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,08■□□□□ 0,17
P01896 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC16,08■□□□□ 0,17
P01896 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC16,08■□□□□ 0,16
P01896 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC16,08■□□□□ 0,16
P01896 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,08■□□□□ 0,16
P01896 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,08■□□□□ 0,16
P01896 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,08■□□□□ 0,16
P01896 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,08■□□□□ 0,16
P01896 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16,08■□□□□ 0,16
P01896 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC16,07■□□□□ 0,16
P01896 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC16,07■□□□□ 0,16
P01896 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC16,07■□□□□ 0,16
P01896 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,07■□□□□ 0,16
P01896 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC16,07■□□□□ 0,16
P01896 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16,07■□□□□ 0,16
P01896 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,07■□□□□ 0,16
P01896 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16,07■□□□□ 0,16
P01896 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,07■□□□□ 0,16
P01896 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16,07■□□□□ 0,16
P01896 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16,07■□□□□ 0,16
P01896 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,06■□□□□ 0,16
P01896 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,06■□□□□ 0,16
P01896 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,06■□□□□ 0,16
P01896 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC16,06■□□□□ 0,16
P01896 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC16,06■□□□□ 0,16
P01896 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16,06■□□□□ 0,16
P01896 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC16,06■□□□□ 0,16
P01896 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,05■□□□□ 0,16
P01896 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,05■□□□□ 0,16
P01896 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,05■□□□□ 0,16
P01896 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC16,05■□□□□ 0,16
P01896 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC16,05■□□□□ 0,16
P01896 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,04■□□□□ 0,16
P01896 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16,04■□□□□ 0,16
P01896 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16,04■□□□□ 0,16
P01896 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,04■□□□□ 0,16
P01896 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC16,04■□□□□ 0,16
P01896 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,03■□□□□ 0,16
P01896 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,03■□□□□ 0,16
P01896 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16,03■□□□□ 0,16
P01896 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,03■□□□□ 0,16
P01896 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,03■□□□□ 0,16
P01896 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,03■□□□□ 0,16
P01896 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16,02■□□□□ 0,16
P01896 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC16,02■□□□□ 0,16
P01896 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,02■□□□□ 0,16
P01896 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,02■□□□□ 0,15
P01896 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,02■□□□□ 0,15
P01896 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16,02■□□□□ 0,15
P01896 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,02■□□□□ 0,15
P01896 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,01■□□□□ 0,15
P01896 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16,01■□□□□ 0,15
P01896 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,01■□□□□ 0,15
P01896 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,01■□□□□ 0,15
P01896 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,01■□□□□ 0,15
P01896 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,01■□□□□ 0,15
P01896 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16,01■□□□□ 0,15
P01896 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,01■□□□□ 0,15
P01896 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16,01■□□□□ 0,15
P01896 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0,15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26,1 ms