Protein–RNA interactions for Protein: P01837

Ig kappa chain C region, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01837 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01837 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01837 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
P01837 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01837 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01837 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01837 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01837 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
P01837 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
P01837 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01837 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01837 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01837 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01837 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01837 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01837 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC16■□□□□ 0.15
P01837 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
P01837 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01837 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01837 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
P01837 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01837 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01837 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
P01837 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01837 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01837 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01837 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01837 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01837 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01837 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01837 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01837 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01837 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01837 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01837 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
P01837 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
P01837 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
P01837 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01837 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01837 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01837 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01837 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01837 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
P01837 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01837 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01837 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01837 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01837 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01837 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01837 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01837 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01837 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01837 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01837 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01837 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01837 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01837 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01837 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01837 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01837 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01837 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01837 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01837 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P01837 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01837 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01837 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01837 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01837 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01837 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01837 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01837 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01837 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01837 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01837 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01837 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01837 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01837 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01837 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01837 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01837 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01837 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01837 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01837 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01837 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01837 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01837 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01837 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01837 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01837 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01837 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01837 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P01837 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01837 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01837 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01837 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01837 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01837 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01837 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01837 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01837 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms