Protein–RNA interactions for Protein: P01821

Ig heavy chain V region MC101, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01821 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01821 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01821 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
P01821 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01821 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01821 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01821 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01821 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01821 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01821 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
P01821 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01821 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01821 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01821 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01821 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01821 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01821 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01821 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01821 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
P01821 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01821 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01821 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01821 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
P01821 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01821 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01821 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
P01821 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01821 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01821 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01821 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
P01821 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01821 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01821 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01821 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01821 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01821 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01821 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
P01821 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
P01821 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01821 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01821 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01821 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
P01821 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
P01821 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01821 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01821 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P01821 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
P01821 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
P01821 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01821 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01821 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01821 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01821 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
P01821 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
P01821 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01821 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01821 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
P01821 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01821 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01821 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01821 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01821 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01821 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01821 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01821 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01821 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
P01821 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01821 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01821 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01821 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01821 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01821 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01821 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01821 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
P01821 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P01821 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P01821 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P01821 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P01821 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
P01821 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01821 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01821 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01821 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01821 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01821 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
P01821 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
P01821 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01821 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01821 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
P01821 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01821 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01821 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01821 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
P01821 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01821 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01821 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01821 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01821 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01821 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
P01821 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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