Protein–RNA interactions for Protein: P01668

Ig kappa chain V-III region PC 7210, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01668 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P01668 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
P01668 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
P01668 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
P01668 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
P01668 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
P01668 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
P01668 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
P01668 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P01668 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
P01668 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
P01668 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
P01668 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P01668 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P01668 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
P01668 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
P01668 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P01668 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
P01668 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
P01668 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P01668 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
P01668 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
P01668 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P01668 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
P01668 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
P01668 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
P01668 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P01668 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P01668 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
P01668 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
P01668 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
P01668 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
P01668 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
P01668 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
P01668 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
P01668 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
P01668 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
P01668 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
P01668 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
P01668 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
P01668 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
P01668 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
P01668 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01668 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01668 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01668 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01668 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01668 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
P01668 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
P01668 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
P01668 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
P01668 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
P01668 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
P01668 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
P01668 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
P01668 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
P01668 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
P01668 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
P01668 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
P01668 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
P01668 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
P01668 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
P01668 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
P01668 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
P01668 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
P01668 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
P01668 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
P01668 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P01668 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
P01668 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
P01668 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
P01668 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P01668 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P01668 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
P01668 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
P01668 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
P01668 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
P01668 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
P01668 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
P01668 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01668 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01668 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
P01668 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01668 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01668 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01668 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01668 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
P01668 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
P01668 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
P01668 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
P01668 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
P01668 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
P01668 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
P01668 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P01668 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P01668 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P01668 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P01668 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
P01668 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
P01668 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms