Protein–RNA interactions for Protein: O88255

Gm10509, Mszf57 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 85 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10509O88255 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm10509O88255 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm10509O88255 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm10509O88255 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm10509O88255 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm10509O88255 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm10509O88255 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm10509O88255 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm10509O88255 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm10509O88255 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm10509O88255 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm10509O88255 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm10509O88255 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm10509O88255 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm10509O88255 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm10509O88255 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm10509O88255 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Gm10509O88255 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm10509O88255 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm10509O88255 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm10509O88255 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm10509O88255 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm10509O88255 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm10509O88255 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm10509O88255 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm10509O88255 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm10509O88255 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Gm10509O88255 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm10509O88255 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm10509O88255 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm10509O88255 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm10509O88255 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm10509O88255 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm10509O88255 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Gm10509O88255 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm10509O88255 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm10509O88255 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Gm10509O88255 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm10509O88255 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm10509O88255 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm10509O88255 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm10509O88255 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm10509O88255 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm10509O88255 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm10509O88255 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Gm10509O88255 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm10509O88255 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm10509O88255 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm10509O88255 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm10509O88255 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Gm10509O88255 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm10509O88255 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm10509O88255 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm10509O88255 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm10509O88255 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gm10509O88255 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm10509O88255 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm10509O88255 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm10509O88255 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm10509O88255 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm10509O88255 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm10509O88255 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm10509O88255 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm10509O88255 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm10509O88255 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm10509O88255 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gm10509O88255 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm10509O88255 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm10509O88255 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm10509O88255 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm10509O88255 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm10509O88255 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm10509O88255 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm10509O88255 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm10509O88255 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm10509O88255 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm10509O88255 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gm10509O88255 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm10509O88255 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm10509O88255 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm10509O88255 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm10509O88255 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm10509O88255 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm10509O88255 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gm10509O88255 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gm10509O88255 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm10509O88255 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm10509O88255 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm10509O88255 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm10509O88255 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm10509O88255 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm10509O88255 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm10509O88255 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm10509O88255 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm10509O88255 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm10509O88255 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm10509O88255 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm10509O88255 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10509O88255 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm10509O88255 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34 ms