Protein–RNA interactions for Protein: O70477

Pknox1, Homeobox protein PKNOX1, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pknox1O70477 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pknox1O70477 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pknox1O70477 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pknox1O70477 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pknox1O70477 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pknox1O70477 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pknox1O70477 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pknox1O70477 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pknox1O70477 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pknox1O70477 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pknox1O70477 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pknox1O70477 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pknox1O70477 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pknox1O70477 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pknox1O70477 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pknox1O70477 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pknox1O70477 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pknox1O70477 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pknox1O70477 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Pknox1O70477 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Pknox1O70477 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pknox1O70477 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pknox1O70477 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pknox1O70477 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pknox1O70477 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pknox1O70477 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pknox1O70477 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pknox1O70477 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pknox1O70477 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pknox1O70477 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Pknox1O70477 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pknox1O70477 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pknox1O70477 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pknox1O70477 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pknox1O70477 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Pknox1O70477 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pknox1O70477 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pknox1O70477 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Pknox1O70477 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Pknox1O70477 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Pknox1O70477 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pknox1O70477 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pknox1O70477 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pknox1O70477 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Pknox1O70477 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pknox1O70477 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pknox1O70477 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pknox1O70477 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Pknox1O70477 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pknox1O70477 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Pknox1O70477 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pknox1O70477 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pknox1O70477 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pknox1O70477 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pknox1O70477 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pknox1O70477 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Pknox1O70477 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Pknox1O70477 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pknox1O70477 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pknox1O70477 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pknox1O70477 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Pknox1O70477 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pknox1O70477 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pknox1O70477 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pknox1O70477 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Pknox1O70477 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pknox1O70477 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pknox1O70477 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pknox1O70477 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pknox1O70477 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pknox1O70477 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Pknox1O70477 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pknox1O70477 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pknox1O70477 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pknox1O70477 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Pknox1O70477 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pknox1O70477 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Pknox1O70477 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pknox1O70477 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Pknox1O70477 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pknox1O70477 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pknox1O70477 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pknox1O70477 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pknox1O70477 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pknox1O70477 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pknox1O70477 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Pknox1O70477 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pknox1O70477 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pknox1O70477 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Pknox1O70477 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pknox1O70477 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pknox1O70477 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pknox1O70477 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Pknox1O70477 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pknox1O70477 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pknox1O70477 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pknox1O70477 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pknox1O70477 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pknox1O70477 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Pknox1O70477 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms