Protein–RNA interactions for Protein: O70138

Mmp8, Neutrophil collagenase, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp8O70138 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Mmp8O70138 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Mmp8O70138 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Mmp8O70138 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Mmp8O70138 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Mmp8O70138 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Mmp8O70138 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Mmp8O70138 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Mmp8O70138 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Mmp8O70138 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Mmp8O70138 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Mmp8O70138 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Mmp8O70138 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Mmp8O70138 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Mmp8O70138 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Mmp8O70138 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Mmp8O70138 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Mmp8O70138 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Mmp8O70138 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Mmp8O70138 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Mmp8O70138 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Mmp8O70138 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Mmp8O70138 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Mmp8O70138 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
Mmp8O70138 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Mmp8O70138 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Mmp8O70138 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Mmp8O70138 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Mmp8O70138 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Mmp8O70138 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Mmp8O70138 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Mmp8O70138 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Mmp8O70138 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Mmp8O70138 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Mmp8O70138 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Mmp8O70138 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Mmp8O70138 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Mmp8O70138 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Mmp8O70138 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Mmp8O70138 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Mmp8O70138 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Mmp8O70138 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Mmp8O70138 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Mmp8O70138 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Mmp8O70138 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Mmp8O70138 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Mmp8O70138 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Mmp8O70138 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Mmp8O70138 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Mmp8O70138 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Mmp8O70138 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Mmp8O70138 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Mmp8O70138 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Mmp8O70138 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Mmp8O70138 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Mmp8O70138 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Mmp8O70138 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Mmp8O70138 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Mmp8O70138 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
Mmp8O70138 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Mmp8O70138 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Mmp8O70138 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
Mmp8O70138 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Mmp8O70138 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Mmp8O70138 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Mmp8O70138 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Mmp8O70138 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Mmp8O70138 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Mmp8O70138 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Mmp8O70138 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Mmp8O70138 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Mmp8O70138 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Mmp8O70138 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Mmp8O70138 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Mmp8O70138 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Mmp8O70138 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
Mmp8O70138 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Mmp8O70138 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Mmp8O70138 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Mmp8O70138 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Mmp8O70138 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Mmp8O70138 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Mmp8O70138 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Mmp8O70138 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Mmp8O70138 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Mmp8O70138 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Mmp8O70138 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Mmp8O70138 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
Mmp8O70138 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Mmp8O70138 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Mmp8O70138 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Mmp8O70138 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Mmp8O70138 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Mmp8O70138 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Mmp8O70138 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Mmp8O70138 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Mmp8O70138 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Mmp8O70138 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Mmp8O70138 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Mmp8O70138 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.1 ms