Protein–RNA interactions for Protein: O55126

Nipsnap2, Protein NipSnap homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap2O55126 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nipsnap2O55126 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nipsnap2O55126 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Nipsnap2O55126 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nipsnap2O55126 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nipsnap2O55126 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Nipsnap2O55126 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nipsnap2O55126 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nipsnap2O55126 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Nipsnap2O55126 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nipsnap2O55126 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nipsnap2O55126 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Nipsnap2O55126 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nipsnap2O55126 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Nipsnap2O55126 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nipsnap2O55126 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nipsnap2O55126 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nipsnap2O55126 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nipsnap2O55126 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nipsnap2O55126 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Nipsnap2O55126 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Nipsnap2O55126 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nipsnap2O55126 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Nipsnap2O55126 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nipsnap2O55126 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nipsnap2O55126 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Nipsnap2O55126 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nipsnap2O55126 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Nipsnap2O55126 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nipsnap2O55126 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Nipsnap2O55126 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nipsnap2O55126 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Nipsnap2O55126 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nipsnap2O55126 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nipsnap2O55126 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nipsnap2O55126 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nipsnap2O55126 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Nipsnap2O55126 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nipsnap2O55126 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nipsnap2O55126 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nipsnap2O55126 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Nipsnap2O55126 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nipsnap2O55126 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Nipsnap2O55126 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nipsnap2O55126 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Nipsnap2O55126 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nipsnap2O55126 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nipsnap2O55126 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Nipsnap2O55126 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.33■■□□□ 1
Nipsnap2O55126 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Nipsnap2O55126 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nipsnap2O55126 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nipsnap2O55126 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Nipsnap2O55126 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nipsnap2O55126 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Nipsnap2O55126 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Nipsnap2O55126 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nipsnap2O55126 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Nipsnap2O55126 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nipsnap2O55126 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nipsnap2O55126 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Nipsnap2O55126 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nipsnap2O55126 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Nipsnap2O55126 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Nipsnap2O55126 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nipsnap2O55126 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Nipsnap2O55126 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nipsnap2O55126 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nipsnap2O55126 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Nipsnap2O55126 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Nipsnap2O55126 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Nipsnap2O55126 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Nipsnap2O55126 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nipsnap2O55126 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Nipsnap2O55126 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Nipsnap2O55126 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nipsnap2O55126 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nipsnap2O55126 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nipsnap2O55126 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Nipsnap2O55126 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Nipsnap2O55126 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Nipsnap2O55126 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nipsnap2O55126 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Nipsnap2O55126 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Nipsnap2O55126 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nipsnap2O55126 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nipsnap2O55126 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nipsnap2O55126 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nipsnap2O55126 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Nipsnap2O55126 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nipsnap2O55126 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nipsnap2O55126 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nipsnap2O55126 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nipsnap2O55126 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Nipsnap2O55126 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nipsnap2O55126 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nipsnap2O55126 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nipsnap2O55126 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nipsnap2O55126 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Nipsnap2O55126 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms