Protein–RNA interactions for Protein: O55033

Nck2, Cytoplasmic protein NCK2, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nck2O55033 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nck2O55033 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Nck2O55033 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nck2O55033 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nck2O55033 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nck2O55033 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nck2O55033 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nck2O55033 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nck2O55033 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Nck2O55033 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nck2O55033 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nck2O55033 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nck2O55033 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nck2O55033 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Nck2O55033 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nck2O55033 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Nck2O55033 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Nck2O55033 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Nck2O55033 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nck2O55033 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Nck2O55033 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Nck2O55033 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Nck2O55033 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nck2O55033 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Nck2O55033 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nck2O55033 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Nck2O55033 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nck2O55033 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nck2O55033 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nck2O55033 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Nck2O55033 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nck2O55033 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nck2O55033 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nck2O55033 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nck2O55033 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nck2O55033 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Nck2O55033 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nck2O55033 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Nck2O55033 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Nck2O55033 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nck2O55033 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Nck2O55033 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nck2O55033 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nck2O55033 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nck2O55033 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nck2O55033 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Nck2O55033 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nck2O55033 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nck2O55033 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nck2O55033 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Nck2O55033 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nck2O55033 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nck2O55033 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nck2O55033 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nck2O55033 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nck2O55033 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nck2O55033 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Nck2O55033 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nck2O55033 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nck2O55033 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nck2O55033 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Nck2O55033 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nck2O55033 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nck2O55033 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nck2O55033 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Nck2O55033 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Nck2O55033 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Nck2O55033 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Nck2O55033 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nck2O55033 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nck2O55033 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Nck2O55033 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Nck2O55033 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nck2O55033 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nck2O55033 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nck2O55033 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Nck2O55033 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nck2O55033 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nck2O55033 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Nck2O55033 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nck2O55033 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nck2O55033 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nck2O55033 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nck2O55033 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nck2O55033 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Nck2O55033 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nck2O55033 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nck2O55033 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nck2O55033 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nck2O55033 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Nck2O55033 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Nck2O55033 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Nck2O55033 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Nck2O55033 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Nck2O55033 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nck2O55033 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nck2O55033 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Nck2O55033 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nck2O55033 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Nck2O55033 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms