Protein–RNA interactions for Protein: O54988

Slk, STE20-like serine/threonine-protein kinase, mousemouse

Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SlkO54988 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SlkO54988 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SlkO54988 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SlkO54988 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SlkO54988 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SlkO54988 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SlkO54988 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SlkO54988 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SlkO54988 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SlkO54988 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SlkO54988 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SlkO54988 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SlkO54988 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SlkO54988 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SlkO54988 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SlkO54988 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SlkO54988 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SlkO54988 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
SlkO54988 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SlkO54988 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SlkO54988 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
SlkO54988 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SlkO54988 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SlkO54988 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SlkO54988 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SlkO54988 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SlkO54988 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SlkO54988 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SlkO54988 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SlkO54988 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SlkO54988 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SlkO54988 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SlkO54988 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
SlkO54988 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SlkO54988 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SlkO54988 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
SlkO54988 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SlkO54988 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SlkO54988 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SlkO54988 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SlkO54988 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SlkO54988 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SlkO54988 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SlkO54988 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SlkO54988 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SlkO54988 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SlkO54988 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SlkO54988 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SlkO54988 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SlkO54988 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SlkO54988 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SlkO54988 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SlkO54988 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SlkO54988 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SlkO54988 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SlkO54988 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
SlkO54988 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SlkO54988 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SlkO54988 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
SlkO54988 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SlkO54988 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SlkO54988 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SlkO54988 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SlkO54988 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
SlkO54988 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SlkO54988 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SlkO54988 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
SlkO54988 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SlkO54988 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SlkO54988 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SlkO54988 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SlkO54988 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
SlkO54988 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SlkO54988 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
SlkO54988 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SlkO54988 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
SlkO54988 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SlkO54988 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SlkO54988 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
SlkO54988 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SlkO54988 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
SlkO54988 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
SlkO54988 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
SlkO54988 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SlkO54988 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
SlkO54988 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
SlkO54988 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SlkO54988 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
SlkO54988 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
SlkO54988 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
SlkO54988 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
SlkO54988 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SlkO54988 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
SlkO54988 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
SlkO54988 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SlkO54988 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SlkO54988 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SlkO54988 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
SlkO54988 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
SlkO54988 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms